来自二进制矩阵 R 的网络图答案

【问题标题】：network diagram from binary matrix R来自二进制矩阵 R 的网络图
【发布时间】：2014-08-14 15:27:58
【问题描述】：

我有以下二进制矩阵，显示每个关键字出现在哪篇文章中。

        keyword1  keyword2  keyword3
  art1    0          1        0
  art2    1          1        0
  art3    0          0        1

我尝试了以下技术来创建邻接矩阵，但我不确定它是否正确以及值的含义

  df1 <- data.frame(keyword1=c(0,1,0),keyword2=c(1,1,0),keyword3=c(0,0,1),row.names=c("art1","art2","art3"))
  df1.mt <- as.matrix(df1)
  df1.adj <- t(df1.mt) %*% df1.mt

此时我已经创建了以下邻接矩阵

          keyword1  keyword2  keyword3
  keyword1   1         1        0
  keyword2   1         2        0
  keyword3   0         0        1

这是一个邻接矩阵吗？它是否通过文章显示关键字之间的关系？我可以用它来画网络图吗？请问如何？

感谢您的帮助。

【问题讨论】：

标签： r matrix correlation adjacency-matrix

【解决方案1】：

如果您不熟悉 igraph 包，它是一个可以轻松完成此类任务的网络包：

library(igraph)
g <- graph.adjacency(df1.adj)
plot(g)

第一个矩阵是一个布尔矩阵。您所做的转换是邻接矩阵，对角线是关键字显示的总次数。非对角线是两个关键字（节点）之间的链接（边）。这些边缘也可以加权。

这给出了：

您还可以将对角线设置为零以避免边缘是循环：

diag(df1.adj) <- 0
g <- graph.adjacency(df1.adj)
plot(g)

屈服：

【讨论】：

谢谢你这是一个很好的答案，我不知道诊断。