Sweave/ODFWeave 和跟踪代码块

Question

我开始使用 R 中的可重复研究工具，我对前景感到非常兴奋。 Sweave/Knitr/Markdown，所有这些都很棒。我使用 RStudio，他们在集成这些工具方面做得很好，我听说 StatET 也很好地将所有这些整合在一起。

我不使用 LaTeX 撰写学术论文，与我一起工作的所有人都使用 Word，因此我对使用 ODFWeave 制作文档的有效工作流程非常感兴趣。

我平时的流程是：

1. 在我的 IDE（在我的例子中是 RStudio）中开发代码块
2. 返回并将这些插入 ODT 文档并填写周围的文本。
3. 运行 ODFweave

我的问题是我在跟踪代码块并将它们放入 ODF 文档时感到困惑。在创建代码时保持 ODF 文档同步很烦人，所以我宁愿等待并按名称插入代码块。

最后，这是我的问题：

• 人们对跟踪代码块或如何优化此工作流程有什么建议？
• 谁能推荐一些工具或技巧来跟踪您编写的代码块？

作为一个软件极客和一个数据书呆子，我自然会想象一个软件会为我做这件事。就像我有一个代码块数据库一样，在编写 ODF 文档时，我可以单击一个块将其插入到我的 ODF 文件中。

• 有人创造过这种东西吗？

Answer 1

当您检查 SO 上标记为 odfweave 的项目数量时，您会注意到与 Sweave 和 knit-offs 相比，它很少使用。我不完全理解为什么它没有起飞，可能是因为表生成太麻烦了（至少我从尝试中记得是这样）。

由于许多客户坚持使用 Word 文档，我们目前使用两种替代方案：

• 创建 html，例如使用 RStudio/knitr/rmd，并使用 Word 阅读。这不是一个真正好的工作流程，要获得合理的文档，您需要进行大量手动后期处理，但它或多或少都有效。
• 您也可以通过 RDCOM 使用该路径。我不记得这里的最新技术是什么，因为我们完全放弃了使用它，因为许可条件对我们不透明。
• 使用pandoc。这种方法生成的文档不需要在 MS-Word 中进行手动后处理，但是创建漂亮布局的功能范围（交叉链接图像、图形编号）是有限的；这可能是一个问题，我们在完整使用 pandoc 方面还不够好。