使用 Edgelist 从二分图构建隶属网络答案

【问题标题】：Using Edgelist to construct affiliation networks from a bipartite graph使用 Edgelist 从二分图构建隶属网络
【发布时间】：2017-02-16 16:40:54
【问题描述】：

我有一个代表二分网络的边缘列表。

ID1 是一类演员，ID2 是另一类演员。如何为参与者类（ID1 中的所有顶点作为一个类，ID2 中的所有顶点作为另一个类）分配属性以将其用于二分网络分析。另外，我想从二分图中提取从属网络作为两个单独的图，并希望将它们导出。

重现数据框的代码可以在这里找到

x<-as.data.frame(matrix(c(1,1,1,2,2,3,3,3,123,124,125,123,126,127,123,130),8,2))
colnames(x) <- c("ID1", "ID2")
g <- graph.data.frame(x, directed=F)

提前致谢！

【问题讨论】：

我不明白你在问什么。这里期望的输出是什么？图g需要怎么改？
在这种当前形式中，我无法创建二分图，但我找不到分配值的解决方案（根据 igraph 文档，一类参与者需要分配值 TRUE，另一需要为列分配值 FALSE 以便将其检测为二分图）。我希望这能让它更清楚一点？

标签： r igraph

【解决方案1】：

您基本上只需要使用 data.frame 中的数据为顶点分配一个类型属性。例如

is_bipartite(g)
# [1] FALSE
V(g)$type <- V(g)$name %in% x[["ID1"]]
is_bipartite(g)
# [1] TRUE

此代码使用顶点的名称将第一列中的所有顶点设置为 TRUE。

【讨论】：