【问题标题】:regression on subsets for unique factor combinations using lm使用 lm 对独特因子组合的子集进行回归
【发布时间】:2012-02-01 13:47:42
【问题描述】:

我想为分组变量的唯一组合定义的子集自动执行简单的多元回归。我有一个数据框,其中包含几个分组变量 df1[,1:6] 和一些自变量 df1[,8:10] 和一个响应 df1[,7]。

这是数据的摘录。

structure(list(Surface = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L), .Label = c("NiAu", "Sn"), class = "factor"), Supplier = structure(c(1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L), .Label = c("A", "B"), class = "factor"), ParticleSize = structure(c(1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L), .Label = c("3", "5"), class = "factor"), T1 = structure(c(2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 1L, 1L), .Label = c("130", "144"), class = "factor"), T2 = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L), .Label = "200", class = "factor"), O2 = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L), .Label = "1300", class = "factor"), Shear = c(56.83, 67.73, 78.51, 62.61, 66.78, 60.89, 62.94, 76.34, 70.56, 70.4, 54.15), Gap = c(373, 450, 417, 450, 406, 439, 439, 417, 439, 441, 417), Clearance = c(500.13, 509.85, 495.97, 499.55, 502.66, 505.33, 500.32, 503.28, 507.44, 500.5, 498.39), Void = c(316, 343, 89, 247, 271, 326, 304, 282, 437, 243, 116)), .Names = c("Surface", "Supplier", "ParticleSize","T1", "T2", "O2", "Shear", "Gap", "Clearance", "Void"), class = "data.frame", row.names = c(NA, -11L))

使用 unique(df1[,1:6]) 返回分组变量的 5 个因子组合。所以应该有 5 个子集我应用 lm() 函数。 我的电话是这样的

df1.fit.by<-with(df1,by(df1,df1[,1:6], function(x) lm(Shear~Gap+Clearance+Void,data=x)))
sapply(df1.fit.by,coef)

问题 1:它返回一个包含 16 个列表条目的列表。显然,它计算了前六个分组变量的所有可能的因子组合。 (V5+V6只有on水平,而V1:4在节选中有两个水平水平。导致2^4=16)但它应该只使用数据中真实存在的因素组合。所以我想 by() 不是实现这一目标的正确功能。有什么建议吗?
问题 2:我发现引用列索引而不是变量名更容易。所以我最初试图以 lm(df1[,7]~df1[,8]+df1[,9]) 的方式使用我的 lm() 函数。那没有成功。因为我总是访问整个 df1 数据框而不是子集。所以可能我应该将因子组合的行索引传递给 lm() 函数而不是完整的数据框。

我认为问题 1 和 2 的解决方案在某种程度上是相关的,并使用另一个子集函数来解决。如果有人可以尝试解释我的错误在哪里,那就太好了。如果可能的话,我会坚持使用标准包,因为我想提高对 R 的理解。谢谢

编辑:变量赋值中的一个小错误

【问题讨论】:

  • 谢谢,我还没有找到那个帖子。看起来它解释了一些好的策略。谢谢你。对于重复的帖子,我们深表歉意。

标签: r subset lm


【解决方案1】:

您可以使用plyr 包:

require(plyr)
list_reg <- dlply(df1, .(Surface, Supplier, ParticleSize, T1, T2), function(df) 
  {lm(Shear~Gap+Clearance+Void,data=df)})
#We have indeed five different results
length(list_reg)
#That's how you check out one particular regression, in this case the first
summary(list_reg[[1]])

函数dlply 接受data.frame(这就是 d... 的含义),在您的情况下为df1,并返回一个列表(这就是 .l... 的含义),在您的案例由五个元素组成,每个元素包含一个回归的结果。

在内部,您的df1 根据.(Surface, Supplier, ParticleSize, T1, T2) 指定的列分为五个子data.frames,并且函数lm(Shear~Gap+Clearance+Void,data=df) 应用于每个子data.frames。

要更好地了解dlply 的实际作用,请致电

list_sub_df <- dlply(df1, .(Surface, Supplier, ParticleSize, T1, T2))

您可以查看将应用lm 的每个子data.frame。

最后只是一个一般说明:包作者 Hadley Wickham 的 paper 非常棒:即使你最终不会使用他的包,但对拆分有一种感觉仍然非常好- 应用组合方法。

编辑:

我刚刚进行了快速搜索,正如预期的那样,这已经在之前得到了更好的解释,所以也请务必阅读此SO 帖子。

EDIT2:

如果你想直接使用列号,试试这个(取自 SO 帖子):

 list_reg <- dlply(df1, names(df1[, 1:5]), function(df) 
      {lm(Shear~Gap+Clearance+Void,data=df)})

【讨论】:

  • 谢谢克里斯托夫。我从名字就知道 plyr。它有相当多的文字要通读。但是,我确信您的解决方案完全符合我的要求。我仍然想知道是否有一种方法可以避免命名变量而是使用括号表示法。
  • 感谢 christoph,实际上我指的是公式表达式:Shear~Gap+Clearance+Void 我曾经用 lm(df[,7]~df[,8]+df[ 进行简单回归,9]) 当我对问题进行矢量化时,它不起作用。但是你给了我一个很好的名字功能提示。这也应该在公式中使用
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