在读取 r 中的 csv 时将列名添加到数据框

Question

我的目录中有多个没有列名的 .csv 文件。因此，在没有标题的情况下阅读它们会出现错误

match.names(clabs, names(xi)) 中的错误： 名称与以前的名称不匹配。

因此，出于这个原因，我想将列名附加到这些 csv 文件中，并将它们全部组合到一个数据帧中，但是在读取它们时我无法将列名添加到这些多个 csv 文件中。文件名如 test_abc.csv、test_pqr.csv、test_xyz.csv 等。 这是我尝试过的

temp = list.files(pattern="*.csv")
read_csv_filename <- function(filename){
  ret <- read.csv(filename,header = F)
  ret$city <- gsub(".*[_]([^.]+)[.].*", "\\1", filename) 
  ret
}

df_all <- do.call(rbind,lapply(temp,read_csv_filename))

如何在阅读时将标题添加到每个文件？

这是我想在阅读时添加的名称

colnames = c("Age","Gender","height","weight")

有什么建议吗？

Answer 1

使用tidyverse 包，您可以使用purrr::map_dfr 函数很好地做到这一点，该函数迭代列表，对每次返回数据帧的每个元素执行一些函数，并将所有这些数据帧绑定在一起。

library(readr)
library(purrr)
library(dplyr) # only used in example set up

# Setting up some example csv files to work with

mtcars_slim <- select(mtcars, 1:3)

write_csv(slice(mtcars_slim, 1:4), "mtcars_1.csv", col_names = FALSE)
write_csv(slice(mtcars_slim, 5:10), "mtcars_2.csv", col_names = FALSE)
write_csv(slice(mtcars_slim, 11:1), "mtcars_3.csv", col_names = FALSE)


# get file paths, read them all, and row-bind them all

dir(pattern = "mtcars_\\d+\\.csv") %>% 
  map_dfr(read_csv, col_names = c("mpg", "cyl", "disp"))

#> Parsed with column specification:
#> cols(
#>   mpg = col_double(),
#>   cyl = col_integer(),
#>   disp = col_integer()
#> )

#> # A tibble: 21 x 3
#>      mpg   cyl  disp
#>    <dbl> <int> <dbl>
#>  1  21.0     6 160.0
#>  2  21.0     6 160.0
#>  3  22.8     4 108.0
#>  4  21.4     6 258.0
#>  5  18.7     8 360.0
#>  6  18.1     6 225.0
#>  7  14.3     8 360.0
#>  8  24.4     4 146.7
#>  9  22.8     4 140.8
#> 10  19.2     6 167.6
#> # ... with 11 more rows

Answer 2

您可以像这样将列名放在循环本身中

temp = list.files(pattern="*.csv")
read_csv_filename <- function(filename){
  ret <- read.csv(filename,header = F)
  ret$city <- gsub(".*[_]([^.]+)[.].*", "\\1", filename) 
  colnames(ret) <- c("Age","Gender","height","weight","city")

  ret
}

df_all <- do.call(rbind,lapply(temp,read_csv_filename))