用python绘制正值的小提琴图答案

【问题标题】：Violin plot for positive values with python用python绘制正值的小提琴图
【发布时间】：2020-01-08 15:50:29
【问题描述】：

我发现小提琴图非常有用，我使用 python 库“seaborn”。但是，当应用于正值时，它们几乎总是在低端显示负值。我发现这确实具有误导性，尤其是在处理现实生活中的数据集时。

在seaborn的官方文档中https://seaborn.pydata.org/generated/seaborn.violinplot.html 可以看到带有“total_bill”和“tip”的示例，它们不是是否为负数。然而，小提琴图显示负值。例如，

import seaborn as sns
sns.set(style="whitegrid")
tips = sns.load_dataset("tips")
ax = sns.violinplot(x="day", y="total_bill", hue="smoker",data=tips, palette="muted", split=True)

我明白，那些负值来自高斯核。因此，我的问题是：有没有办法解决这个问题？ python中的另一个库？是否可以指定不同的内核？

【问题讨论】：

小提琴图是在轴上对齐的两个 KDE 图。您看到的“负”值只是 KDE 的产物。它们是对数据中值的估计。这并不是说您有负数据，而是说您的数据包含非常接近负值的值，即 0。因此，您从数据集中选择负值的估计概率不为零。
内核密度定义在从 -infinity 到 +infinity 的整个范围内。
我确实了解这些价值观的来源。我正在寻找出路。例如，我可以梦想使用截断的高斯核进行 KDE 估计。我为什么担心？ Wenn 使用现实生活中的数据集，我的数据几乎总是很脏，我几乎总是在做一些清理工作。查看带有负值的小提琴图（不久前创建），您永远无法确定，如果您在清理过程中遗漏了什么，或者这是 KDE 的产物
检查例如this。为了检查您的数据中是否有负值，请使用numpy.any(data < 0)
是的，当然，我一直在这样做。但我想从我的情节中获得直觉。我想向我的业务用户展示这些情节。我希望这种直觉不会误导

标签： python seaborn visualization data-analysis violin-plot

【解决方案1】：

您可以使用关键字cut=0 将绘图限制在数据范围内。如果数据没有负值，这会将小提琴的末端削为零。使用与您相同的示例，尝试：

ax = sns.violinplot(x="day", y="total_bill", hue="smoker",data=tips, palette="muted", split=True,cut=0)

【讨论】：