R，我怎样才能用一个简单的矩阵制作热图？ [复制]答案

【问题标题】：R, how can I make a heatmap out of a simple matrix? [duplicate]R，我怎样才能用一个简单的矩阵制作热图？ [复制]
【发布时间】：2016-01-07 21:53:06
【问题描述】：

假设我有一个由生成的简单矩阵 A

 A = matrix(c(1,2,3,4,5,6,7,8,9),nrow=3,ncol=3)

现在，我的目标是用 A 制作一个热图，这样每个数字都被一个颜色字段替换。怎么做？我试过了

heatmap(A)

但它产生了三个彩色条纹而不是 9 个不同的字段。

【问题讨论】：

您应该查看 ggplot2 包中的 geom_tile 方法（作为示例），并且很可能将您的矩阵转换为 data.frame。此链接可能会有所帮助：learnr.wordpress.com/2010/01/26/ggplot2-quick-heatmap-plotting

【解决方案1】：

cmets 中提到的解决方案中未描述的一种可能性在于使用pheatmap 包：

library(pheatmap)
A <- matrix(c(1,2,3,4,5,6,7,8,9),nrow=3,ncol=3)
pheatmap(A, cluster_rows = FALSE, cluster_cols = FALSE)

给出：

【讨论】：