Runtime.getRuntime.exec() 适用于 Windows 但不适用于 Linux

Question

我正在构建一个 Java 应用程序，它调用系统命令并在将控制权返回给 Java 线程之前执行该命令。我的调试步骤是我制作了一个名为 test.pl 的 perl 脚本，我从 Java 方法调用该脚本，在 Windows 中，我得到预期的输出和返回值 0。在 Linux 中，我没有得到任何输出或错误输出，我得到 136 的返回值。我在网上花费了大量时间试图找出哪里出错了，但正如我所说，它在 Windows 上运行。我认为这一定是一个我没有发现的简单错误。

这里是来自http://www.javaworld.com/jw-12-2000/jw-1229-traps.html优秀的 Runtime.exec() 教程的代码

try {

    FileOutputStream fos = new FileOutputStream("output/" + this.startPosition + ".txt");
    Runtime rt = Runtime.getRuntime();
    Process proc = rt.exec(new String[]{"perl", "/data/stat-positive-selection/thaddeus/treesim/chr2YRI/test.pl"});

//System.out.println(commandLine);
// any error message?
StreamGobbler errorGobbler = new 
   StreamGobbler(proc.getErrorStream(), "ERROR");            

// any output?
StreamGobbler outputGobbler = new 
    StreamGobbler(proc.getInputStream(), "OUTPUT", fos);

// kick them off
errorGobbler.start();
outputGobbler.start();

// any error???
int exitVal = proc.waitFor();
System.out.println("ExitValue: " + exitVal);

fos.flush();
fos.close(); 
} catch (Throwable e){
    e.printStackTrace();
    }
}

我已经弄清楚并修复了代码

新的exec调用，需要使用shell和perl的路径

Process proc = rt.exec(new String[]{"/bin/bash", "-c", "/usr/bin/perl /data/stat-positive-selection/thaddeus/treesim/chr2YRI/test.pl"});

Answer 1

新旧版本的区别在于：

• 您正在从 shell 运行命令，并且
• 您正在指定“perl”命令的完整路径名。

事实上，在这种情况下，从 shell 运行命令似乎没有什么意义。 （假设您的 Perl 应用程序可能依赖于在 shell 初始化期间设置的环境变量。但是，相同的环境变量通常会被 Java 命令的环境继承，然后从 Java 命令的环境继承。所以除非 Java 命令是以一种奇怪的方式启动，这种情况......不太可能。）

所以我认为 substantative 区别¹ 是您使用“perl”的完整路径名......而您没有子shell 来执行此操作。

所以，为了科学的利益（:-)）我建议你试试这个：

    Process proc = rt.exec(new String[]{
            "/usr/bin/perl", 
            "/data/stat-positive-selection/thaddeus/treesim/chr2YRI/test.pl"});

---

^{1 - ... 与众不同的区别}

Answer 2

我用 Apache Commons Exec 库替换了整个 Runtime.exec() 结构。它解决了我遇到的问题。

http://commons.apache.org/proper/commons-exec/tutorial.html