rpy2中的R maptools wrld_simpl答案

【问题标题】：R maptools wrld_simpl in rpy2rpy2中的R maptools wrld_simpl
【发布时间】：2021-03-16 06:52:04
【问题描述】：

在 R 中：

import(maptools)
data(wrld_simpl)

在python rpy2中，如何访问wrld_simpl？以下代码（在 Python 中）失败如下...package "maptools" has no attribute wrld_simpl

maptools = importr('maptools')
data = DataFrame(maptools.wrld_simpl)

只是想了解 rpy2（并从大学时代重温 R）

【问题讨论】：

标签： python r rpy2 maptools

【解决方案1】：

使用rpy2.robjects.packages.data，如rpy2 introduction所示：

>>> from rpy2.robjects.packages import importr, data

>>> maptools = importr('maptools')
>>> spatial_df_r = data(maptools).fetch('wrld_simpl')['wrld_simpl']
>>> spatial_df_r
<rpy2.robjects.methods.RS4 object at 0x7ffa932b0cc0> [RTYPES.S4SXP]
R classes: ('SpatialPolygonsDataFrame',)

您似乎还试图将数据转换为pandas.DataFrame。小问题是数据不是数据框，而是SpatialPolygonsDataFrame 对象。但是，您可以将其转换为正确的data.frame：

>>> base = importr('base')
>>> df_r = base.as_data_frame(spatial_df_r)
>>> tuple(df_r.rclass)
('data.frame',)

然后到pandas DataFrame：

from rpy2.robjects import conversion
from rpy2.robjects import default_converter, pandas2ri

with conversion.localconverter(default_converter + pandas2ri.converter):
    df = conversion.rpy2py(df_r)

df 现在是 pandas DataFrame：

>>> type(df)
<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>

但是，如果您使用的是 Jupyter，则可以使用 rpy2 魔术的 -o 选项更轻松地完成转换，请参阅：using rpy2 in notebooks 和 rpy2.ipython.rmagic。

【讨论】：