RNetLogo 在 Mac Yosemite 上不起作用

Question

我刚试过这个，但我收到了这个错误消息。关于如何解决它的任何想法？我用的是R版本3.1.1，RNetLogo_1.0-1，平台是x86_64-apple-darwin13.1.0（64位），Java 7 update 60。

Sys.setenv(NOAWT=1)
library(JGR)
Sys.unsetenv("NOAWT")

JGR()
library(RNetLogo)

nl.path <- "/Applications/NetLogo 5.1.0"
NLStart(nl.path) 
Error in .jnew("nlcon/Preprocess") : 
  java.lang.UnsupportedClassVersionError: nlcon/Preprocess : Unsupported major.minor version 51.0

Answer 1

您至少需要 Java 7。

我错过了将包描述中的要求更新为 Java >= 7。 对此感到抱歉。 CRAN 维护人员要求我清理包，即更新到 Java 7 并删除对旧 Java 和 NetLogo 版本的支持。

如果应该使用较旧的 Java，请从 CRAN 存档中获取旧的 RNetLogo 版本（例如 1.0-0）。

最好的祝愿， 一月

Answer 2

您使用的是哪个版本的 RNetLogo？根据http://cran.r-project.org/web/packages/RNetLogo/news.html 的说法，RNetLogo 0.9-6 版本修复了导致“Unsupported major.minor version 51.0”版本错误的bug。

Answer 3

请检查 R 使用的是哪个 Java 版本。 我在使用 Java 7 的 Ubuntu 安装中检查了它，没有任何问题。是的，应 CRAN 维护人员的要求，1.0-1 已删除对非常旧的 Java 和 NetLogo 版本的支持（这不是错误）。

请在 R 中执行以下函数来检查哪个 Java 处于活动状态：

    library(rJava)
    .jinit()
    .jcall("java/lang/System", "S", "getProperty", "java.vm.version")
    .jcall("java/lang/System", "S", "getProperty", "java.vm.name")
    .jcall("java/lang/System", "S", "getProperty", "java.vm.info")
    .jcall("java/lang/System", "S", "getProperty", "java.runtime.version")
    .jcall("java/lang/System", "S", "getProperty", "sun.arch.data.model")

干杯， 一月

Answer 4

想将此作为评论，但我通过奖励问题并获得低于 50 的代表而失去了评论的权利...... :-S

@Jan ：我执行了你提到的功能并得到了以下内容

[1] 0
     .jcall("java/lang/System", "S", "getProperty", "java.vm.version")
[1] "20.65-b04-462"
     .jcall("java/lang/System", "S", "getProperty", "java.vm.name")
[1] "Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM"
     .jcall("java/lang/System", "S", "getProperty", "java.vm.info")
[1] "mixed mode"
     .jcall("java/lang/System", "S", "getProperty", "java.runtime.version")
[1] "1.6.0_65-b14-462-11M4609"
     .jcall("java/lang/System", "S", "getProperty", "sun.arch.data.model")
[1] "64"

我了解 R 可能没有选择正确的 Java 版本。我也收到错误消息

Error in .jnew("nlcon/Preprocess") : 
  java.lang.UnsupportedClassVersionError: nlcon/Preprocess : Unsupported major.minor version 51.0 

我是否正确理解版本 51.0 对应于 Java 7 的某些更新？ Java 7应该有问题吗？我们真的需要确保 R 找到并使用 Java 8 吗？我猜 R 仍在尝试使用 Java 7 提示有问题？知道如何解决这个问题吗？

在 Jan 的最后一个答案之后编辑

@Jan：感谢您跟进这个问题。如果它解决了问题，我可能会选择回到旧版本的 RNetLogo。问题是我安装了 Java 8，所以我希望 R 可以使用它，但不知何故，它似​​乎没有。为了清楚起见，我将开始另一个问题，以便弄清楚如何解决这个问题（请参阅Getting R to use newer versions of java）。

这是从Getting R to use newer versions of java 说的，并且 R 中的错​​误消息提到 version 51 我知道 我确实在使用 Java 7，所以应该有RNetLogo 没问题吧？

Answer 5

在尝试修复它数周后，RNetLogo 终于可以在我的笔记本电脑上使用 Yosemite 和 The Capitan。这里有关于解决方案的技术细节：https://github.com/s-u/rJava/issues/37

这就是我所做的（记住我在终端中使用了 R）：

1. 安装 Java 8 (http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/jdk8-downloads-2133151.html)
2. 从 Mac 安装 Java 6 (http://support.apple.com/kb/DL1572)
3. 必须正确定义 java 主目录。我使用了/Library/Java/Home，但它可能是另一个。您可以使用 eclipse IDE（首选项、已安装的 jRE）来定义目录。
4. 在终端中使用 sudo R CMD javareconf -n 重新配置 R
5. 在终端中，将路径设置为lijvm.dylib

jvm = 'ls /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_60.jdk/Contents/Home/jre/lib/server/lijvm.dylib' sudo install_name_tool -id "$jvm" "$jvm"

4. 安装 rJava 作为源代码install.packages("rJava", type="source")
5. 您可以在终端中检查以确保您已将 rJava 与 1.8 而不是 1.6 相关联。

DYLD_PRINT_LIBRARIES=1 R library(rJava) .jinit() .jcall("java/lang/System", "S", "getProperty", "java.runtime.version")

然后，安装RNetLogo。就是这样。