使用 Hmisc 包查找与 R 中 p 值的相关性答案

【问题标题】：Finding correlation with p-value in R using Hmisc package使用 Hmisc 包查找与 R 中 p 值的相关性
【发布时间】：2023-03-09 14:17:01
【问题描述】：

我正在尝试在 R 中查找数据框变量之间的相关性。我的数据框头部如下。

> head(datafile)

  Taxon   Petals Internode    Sepal    Bract  Petiole     Leaf    Fruit
1     I 5.621498  29.48060 2.462107 18.20341 11.27910 1.128033 7.876151
2     I 4.994617  28.36025 2.429321 17.65205 11.04084 1.197617 7.025416
3     I 4.767505  27.25432 2.570497 19.40838 10.49072 1.003808 7.817479
4     I 6.299446  25.92424 2.066051 18.37915 11.80182 1.614052 7.672492
5     I 6.489375  25.21131 2.901583 17.31305 10.12159 1.813333 7.758443
6     I 5.785868  25.52433 2.655643 17.07216 10.55816 1.955524 7.880880

我用来查找数据框的代码如下

#correlation
install.packages("Hmisc")
library(Hmisc)
rcorr(as.matrix(datafile))

我尝试这样做时遇到以下错误。

> rcorr(as.matrix(datafile))
Error in rcorr(as.matrix(datafile)) : 
  NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 1)
In addition: Warning message:
In storage.mode(x) <- "double" : NAs introduced by coercion

请帮忙。

【问题讨论】：

您可能需要排除名为Taxon 的第一列。对我来说看起来不是很数字。

标签： r dataframe correlation hmisc

【解决方案1】：

是的，就像评论说的那样。我不得不排除变量 Taxon，它不是数字。

【讨论】：