并行运行 MEX 文件时的分段错误

Question

我目前正在重复使用 MATLAB 2012a 中的 MEX 文件的实验，偶尔会遇到我无法理解的分段错误。

关于故障的一些信息

• 它们随机出现

• 仅当我使用 parfor 循环在 Linux 机器上并行运行多次重复实验时才会出现这种情况。

• 当我使用 parfor 循环在 Mac OSX 10.7 上并行运行多次重复实验时，它们确实不会发生。

• 它们确实不在我跑步时出现，或者它们在我按顺序运行重复时出现。

• 当我并行运行 2 个实验而不是 12 个并行实验时，它们的发生频率似乎要低得多。

关于我的 MEX 文件的一些信息：

• 它是用C编写的

• 它使用 IBM CPLEX 12.4 API（这是线程安全的）

• 使用 GCC 4.6.3 编译

我的想法是在多核中访问 MEX 文件可能存在一些问题。任何人都可以阐明可能发生的事情或提出修复建议吗？我很乐意在必要时提供更多信息。

Answer 1

我最近向 MATLAB 的人员发送了堆栈跟踪，结果发现罪魁祸首不是我的代码，而是 CPLEX 12.4 API 中的一个函数。事实证明，这个函数使用了 C 中的 putenv() 函数，它不一定是线程安全的。

不幸的是，我必须继续使用这个函数和 API，所以我发布了一个follow-up thread that focuses on finding ways to avoid this fault。

任何建议将不胜感激。

Answer 2

我的想法是在多核中访问 MEX 文件可能存在一些问题。

您的 MEX 文件更有可能存在错误。各种错误（在 C 中很容易产生），例如访问悬空内存、双free()ing 或写入超过分配数组的末尾，将导致间歇性SIGSEGV。

最好的办法是在调试器下运行 Matlab，看看 在哪里它崩溃了。