ImportError：无法导入 Cython 模块

Question

我在 Cython 语法中有一个名为 neuron 的类，它使用魔术 (%%cython) 与 Jupyter 内联完美配合：

cdef class neuron: pass

我正在尝试对它进行 cythonize 处理，以便我可以将它导入集群并在 conda 环境中使用 Jupyter 运行更大规模的实验。我的setup.py 文件如下所示：

from setuptools import setup, Extension
from Cython.Build import cythonize

extensions = [
Extension("Neuronal_Cascades_cython_Base1", ["Neuronal_Cascades_cython_Base1.pyx"]),
]
setup(
    name="Neuronal_Cascades_cython_Base",
    ext_modules=cythonize(extensions),
)

Cythonize 工作正常，.so 和 .c 文件创建良好，没有任何错误。但是当我在 Jupyter notebook 中导入这两个模块时，我得到了导入错误：

---------------------------------------------------------------------------
ImportError                               Traceback (most recent call last)
<ipython-input-3-639e2d302e82> in <module>
      1 import matplotlib.pyplot as plt
      2 import numpy as np
----> 3 from Neuronal_Cascades_cython_Base1 import neuron
      4 import os
      5 import pickle

ImportError: cannot import name 'neuron' from 'Neuronal_Cascades_cython_Base1'     (/Users/bengieru/Neuronal_Cascades/Cython/Neuronal_Cascades_cython_Base1.cpython-37m-darwin.so)

谁能告诉我我做错了什么？我觉得它可能与 setup.py 导入依赖项有关，但我不确定如何修复它。

Answer 1

我发现了我的错误。在尝试了一百万件事之后，我认为这与我的 setup.py 或我的源代码无关。存在三个问题：

1. setup.py 需要在父目录中才能正常工作。
2. 一个空的__init__.py 文件需要在子目录中。

父母

|--Neuronal_Cascades_Base1

| |--neuron.pyx

| |--初始化.py

|--setup.py

（有人可以帮我很好地格式化这棵树吗？）

1. 当您使用 Jupiter notebook 下拉菜单中的“另存为”保存 .ipynb 文件时，neuron.pyx 会创建一个看起来很奇怪的文件，并且还有许多其他不必要的元数据。因此，删除 neuron.pyx 中的所有内容并简单地将原始 cython 源代码复制粘贴到 neuron.pyx 中即可解决问题。