【发布时间】：2016-11-18 12:57:27
【问题描述】：
我有一个 tiff 文件，它有多个使用 ImageJ 以 Z 堆栈排列的灰度图像，形成 3D 图像。我想从这张图片中提取某些对象，即细胞体或轴突。
我不是在寻找自动分割，而是希望手动选择所需的区域。但是，我找不到可以让我在 3D tiff 图像中绘制选区并导出所选区域的软件。
所以我的问题是有没有这样的软件？
【问题讨论】：
标签： tiff image-segmentation imagej
【发布时间】：2016-11-18 12:57:27
【问题描述】：
您可以使用 3D 套件来执行自动分割和 3D 测量，请参阅：
http://imagejdocu.tudor.lu/doku.php?id=plugin:stacks:3d_ij_suite:start
如果您有一个堆栈，您还可以手动标记和填充您的对象以提取和测量它们，例如3D 对象计数器。
另一种可能性是使用可训练分割插件来标记堆栈中的相似区域，请参阅：
【讨论】：