【问题标题】:Batch analysis on ImageJ (Fiji)ImageJ 的批量分析(斐济)
【发布时间】:2018-06-21 13:31:22
【问题描述】:

您好,我需要分析文件夹树中的 430 个文件

我使用的插件是这个:http://dev.mri.cnrs.fr/projects/imagej-macros/wiki/Intensity_Ratio_Nuclei_Cytoplasm_Tool

分析前的文件需要转换为 16 位灰度图像,然后对其中一些应用特定阈值(都具有相同的文件起始名称,例如 DAPI.tif、DAPI 2.tif) 然后将每个 DAPI X.tif 转换为掩码并使用插件进行分析,然后与其他两个文件(TRITC X.tif 和 FITC X.tif)进行分析,然后保存结果。

最好的方法是什么,因为手动操作需要几个小时? 顺便说一句,我是 imageJ 的初学者,所以详细的说明会很有用。

谢谢大家

【问题讨论】:

    标签: imagej


    【解决方案1】:

    请查看 ImageJ wiki 的此页面:

    https://imagej.net/Batch

    【讨论】:

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