与 ImageJ/斐济接口

Question

有哪些选项可以与另一个程序中的ImageJ/Fiji 进行交互/控制？

我需要使用斐济提供的一些图像过滤器。但是，我不能让斐济成为我工作流程的中心。我为此使用了另一个系统（脚本语言）。我必须在其他系统中处理一些数据，对图像应用过滤器，获得结果，然后继续处理该图像。

我有哪些选择？斐济提供哪些功能使这成为可能？

特别是，如果我使用的系统没有 Java 接口，是否可以这样做？它确实有一个 C 接口，并且可以调用命令行程序。

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对于上下文：我想将斐济与Mathematica 联系起来。 Mathematica 确实有一个 Java 接口，但 it appears to lack support for some Java 8 features that ImageJ requires。我也不太了解 Java，我正在寻找一种可以快速设置的简单解决方案，而不是需要高额初始投资的长期稳健解决方案。

Answer 1

如果您无法通过 Java 集成运行 ImageJ 过滤器，您可以将必要的操作写入 .igm 宏，然后让 ImageJ 在headless 模式下运行它。

否则，将您需要的特定过滤器的 Java 代码移植到更方便的环境中可能会更简单。 ImageJ 主要是为 GUI 使用而设置的，Java/CLI/其他集成很快就会变得混乱。