IJ.close() - 在 ImageJ/FIJI 中编写 python 脚本答案

【问题标题】：IJ.close() - Scripting python in ImageJ/FIJIIJ.close() - 在 ImageJ/FIJI 中编写 python 脚本
【发布时间】：2014-12-18 12:21:13
【问题描述】：

我对 python/脚本非常陌生，但遇到了问题。我正在斐济写以下内容（脚本的缩写版本如下...）

from ij import IJ, ImagePlus
from java.lang import Runtime, Runnable

import os

filepaths = []

for folder, subs, files in os.walk('location/of/files/'):
    for filename in files:
        #the next part stops it appending DS files
        if not filename.startswith('.'):
            filepaths.append(os.path.abspath(os.path.join(folder, filename,)))   

for i in filepaths:
    IJ.open(i);
    IJ.close();

基本上我想打开一个图像，做一些事情，然后使用IJ.close()关闭处理后的图像。但是它给出了以下错误：

AttributeError: type object 'ij.IJ' has no attribute 'close'

知道如何解决这个问题吗？

谢谢！

【问题讨论】：

标签： python jython imagej

【解决方案1】：

IJ 类没有close() 方法。您可能想调用ImagePlus 的close() 方法，这是图像对象本身的类。

尝试类似：

IJ.open(i)
imp = IJ.getImage()
imp.getProcessor().setf(100, 100, 3.14159) # or whatever
IJ.save(imp, "/path/to/myShinyModifiedImage.tif")
imp.close()

如果您需要对多平面图像的多个切片进行操作，另请参阅“切片循环”模板（Script Editor 的模板 > Python 菜单）。

另请注意，Jython 语句的结尾没有分号。

【讨论】：

【解决方案2】：

对于使用 jython（ImageJ/Fiji 中的 python）编写脚本的任何其他人，Java 文档总是有助于了解模块及其类/函数的概述： Here for example for the module ij

【讨论】：