通过 XGrid 运行 BLAST

Question

有人有使用 XGrid 运行 BLAST 的经验吗？

谷歌搜索显示存在一个名为“Xgrid BLAST”的工具，但没有找到。

Answer 1

BLAST 包含在 Xgrid 中。引自“Utilization of a Local Grid of Mac OS X-Based Computers using Xgrid”：

Xgrid 包括一个强大的、 可定制的通用作业 提交界面和Xgrid BLAST， 一个功能齐全、支持网格的 基于Xgrid技术的应用 运行 NCBI BLAST 的实例 局部对齐搜索算法工具。

安装 Xgrid 后，您可以在任何客户端计算机上打开 /Applications/Xgrid BLAST.app。

有关详细信息，请参阅：

• 犹他大学的Xgrid installation documentation。
• How to use Apple's xgrid for running BLAST jobs NACS 研究计算支持小组
• Xgrid basics 由爱丁堡大学进化生物学研究所的 Blaxter 实验室提供。它包括一个示例Perl file，用于向 Xgrid 提交 BLAST 作业。

最后提示，如果您对未来有任何与生物信息学相关的问题，有一个 StackOverflow 克隆专门针对生物信息学家，称为 BioStars。你可能会在那里得到更快的答案。