按类别绘制均值和标准差

Question

我正在尝试按因子的三个水平绘制带有均值和标准差的图。

（在互联网上搜索了两个小时，然后查看了 Rbook 和 Rgraphs 书，我仍然没有找到答案。我认为这是因为这是一个非常简单的问题。）

我有一个包含三列的简单数据框：我的类别、均值、标准差。

我想用按类别的平均值及其 sd 条绘制一个图，就像 this one (edit: link broken)

我的数据框看起来像这样

  color     mean.temp      sd        
  black     37.93431      2.267125        
  red       37.01423      1.852052        
  orange    36.61345      1.339032

我很抱歉提出这个愚蠢的问题，但我真诚地无法为我的简单问题找到任何简单的答案。

Answer 1

ggplot:

读取数据：

df=read.table(text=' color mean.temp   sd
1 black 37.93431 2.267125

2 red 37.01423 1.852052

3 orange 36.61345 1.339032',header=TRUE)

绘图：

 ggplot(df, aes(x=color, y=mean.temp)) + 
     geom_errorbar(aes(ymin=mean.temp-sd, ymax=mean.temp+sd), width=.2) +
     geom_line() +
    geom_point()

输出

Answer 2

创建一个data.frame 来保存您的数据：

foo <- data.frame(color=c("black","red","orange"),
    mean.temp=c(37.93431,37.01423,36.61345),
    sd=c(2.267125,1.852052,1.339032))

现在，我们首先将均值绘制为点，确保水平 (xlim) 和垂直 (ylim) 有足够的空间，抑制 x 轴注释 (xaxt="n") 和所有轴标记 (@987654327 @)。

plot(1:3,foo$mean.temp,pch=19,xlab="",ylab="",xaxt="n",xlim=c(0.5,3.5),
    ylim=c(min(foo$mean.temp-foo$sd),max((foo$mean.temp+foo$sd))))

接下来，我们将标准差绘制为线条。您还可以使用三个单独的lines 命令，这可能更易于阅读。这样，我们首先通过rbind() 将数据收集到矩阵中。 R 会自动将这些矩阵转换为向量并回收它们。 NAs 在那里，所以我们不会将一行的末尾连接到下一行的开头。 （尝试移除 NA 看看会发生什么。）

lines(rbind(1:3,1:3,NA),rbind(foo$mean.temp-foo$sd,foo$mean.temp+foo$sd,NA))

最后，注释x轴：

axis(side=1,at=1:3,labels=foo$color)