将 igraph 对象转换为 R 中的数据框答案

【问题标题】：Convert igraph object to a data frame in R将 igraph 对象转换为 R 中的数据框
【发布时间】：2011-06-21 18:09:25
【问题描述】：

我正在使用 iGraph 库，我需要在网络上运行一些统计分析。我正在使用 iGraph 计算几个变量，然后想将这些指标用作一些回归中的因变量，并将顶点属性用作模型中的自变量。

所以，我能够加载数据、运行 igraph 分析，但我无法将 igraph 对象转回数据框。我真的不需要保留边缘，只需将每个顶点变成一个观察值，其中属性作为每行中的一列。

我尝试了以下方法：

fg <- fastgreedy.community(uncompg, merges=TRUE)
z<-which.max(fg$modularity)
fgc<- community.to.membership(uncompg, fg$merges,z)
names<-array(V(uncompg)$name)
fccommunity<-array(fgc$membership)
fcresult<-as.matrix(cbind(names,fccommunity))
compg <- set.vertex.attribute(compg, "community", value=fccommunity)

uncompg<-simplify(as.undirected(compg))
hubscore<-hub.score(compg)$vector
authscore<-authority.score(compg)$vector

netdata<-as.data.frame(compg)

但它会抛出以下错误：

  cannot coerce class '"igraph"' into a data.frame

任何帮助或指针将不胜感激。

【问题讨论】：

我以前没有使用过 igraph 数据，但如果你能提供一个简单的可重现示例，我可能会从 igraph 类中提取数据。
你的意思是 igraph 包
是的，igraph 包。仍在使用术语。

标签： r statistics igraph

【解决方案1】：

我不太确定您要做什么。您希望将关系作为数据框，还是将节点属性作为数据框？

做前者：

> compg.edges <- as.data.frame(get.edgelist(compg))

做后者：

> compg.df <- as.data.frame(list(Vertex=V(compg), Community=fccommunity, Hubscore=hubscore, Authscore=authscore), stringsAsFactors=FALSE)

【讨论】：

我实际上是在尝试做后者，但前者也非常有用。我正在尝试将一些计算得到的网络属性带回数据框中，以对它们进行一些 logit 分析。
顺便说一句，我喜欢你的博客！