R，求度、接近度和介数的误差答案

【问题标题】：R, error in finding degree, closeness and betweennessR，求度、接近度和介数的误差
【发布时间】：2019-04-01 11:27:46
【问题描述】：

尝试将常见的中心性度量应用于一个简单的无向数据集，如下所示：

报错：

Error in closeness(net, gmode = "graph") : unused argument (gmode = "graph")

当我删除参数 (gmode = "graph) 时，它给出：

Error in degree(W) : Not a graph object

我试过用这行来转换它们，但还是不行：

W <- graph_from_adjacency_matrix(df)
W <- graph_from_data_frame(df)

我该如何纠正它们？谢谢。

下面是几行：

Bob <- c(0,1,0,0,0)
Kate <- c(0,0,0,1,0)
David <- c(0,0,0,1,0)
Jack <- c(0,0,1,0,0)
Peter <- c(0,1,0,0,1)
df <- data.frame(Bob, Kate, David, Jack, Peter)

library(igraph)

W <- data.frame(df)
net <- network(W)

net %v% 'vertex.names'

degree(W, gmode="graph")
closeness(net, gmode="graph")
betweenness(net, gmode="graph")

回答此问题后的附加组件，以防它可以帮助某人 - 将 Excel 格式转换为 adjacency_matrix，请使用以下行。

df <- readxl::read_excel("spreadsheet.xlsx", sheet = "Sheet1")
W <- as.matrix(df)
W <- graph_from_adjacency_matrix(W)

【问题讨论】：

标签： r igraph social-networking sna

【解决方案1】：

你的代码有点神秘，暗示可能使用了其他包？在igraph 中没有这样的函数network，函数degree、closeness 和betweenness 没有参数gmode。我相信以下是您所追求的：

library(igraph)
# We are going to use graph_from_adjacency_matrix, so we need a matrix
# rather than a data frame
df <- cbind(Bob, Kate, David, Jack, Peter)

W <- graph_from_adjacency_matrix(df)

V(W)$name
# [1] "Bob"   "Kate"  "David" "Jack"  "Peter"

degree(W)
#   Bob  Kate David  Jack Peter 
#     1     3     2     3     3 
closeness(W)
#        Bob       Kate      David       Jack      Peter 
# 0.05000000 0.08333333 0.11111111 0.16666667 0.05000000 
# Warning message:
# In closeness(W) :
#   At centrality.c:2784 :closeness centrality is not well-defined for disconnected graphs
betweenness(W)
#   Bob  Kate David  Jack Peter 
#     0     4     0     3     0

【讨论】：