使用 #SBATCH 向多个文件 (900+) 添加一列

Question

我正在尝试向文件中添加一列：

1       12098   12258   0.00
1       12553   12721   1.37
1       13331   13701   34.69
1       30334   30503   0.00
1       35045   35544   0.00
1       35618   35778   0.00
1       69077   70017   0.24
1       324294  324394  0.68
1       324427  325605  3.18

所以它看起来像这样：

1       12098   12258   unknown   0.00
1       12553   12721   unknown   1.37
1       13331   13701   unknown   34.69
1       30334   30503   unknown   0.00
1       35045   35544   unknown   0.00
1       35618   35778   unknown   0.00
1       69077   70017   unknown   0.24
1       324294  324394  unknown   0.68
1       324427  325605  unknown   3.18

我已经用这个命令做到了：

awk '$3 = $3 FS "unknown"' <file> > <new_file>

但是，我也有 900 多个文件需要执行此操作，并且每次都输出到一个新文件。我发现 awk 理解起来很复杂，想知道是否有办法使用#SBATCH 脚本或任何其他方法一次处理多个文件？

我对堆栈溢出还很陌生，所以任何帮助都将不胜感激！谢谢！

Answer 1

这是一个替代sed 解决方案，用于进行此更改并内联保存更改：

sed -E -i.bak 's/[^[:blank:]]+$/unknown &/' *.txt

Answer 2

编辑：根据 OP 的 cmets 添加解决方案以将输出保存到输出文件中尝试以下操作。

awk '
FNR==1{
  close(out_file)
  sub(/\./,"_new&",FILENAME)
  out_file=FILENAME
}
{
  $NF="unknown" OFS $NF
  print > (out_file)
}'  *.bed

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如果您不担心行之间的空格，那么您可以尝试以下操作。

awk '{$NF="unknown" OFS $NF} 1'  Input_file

或者使用 GNU awk 最新版本试试：

gawk -i inplace -v INPLACE_SUFFIX=.bak '{$NF="unknown" OFS $NF} 1'  Input_file(s)

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为了让空间看起来不错，你也可以在上面的命令中添加column：

awk '{$NF="unknown" OFS $NF} 1'  Input_file | column -t

或者使用 GNU awk 最新版本试试：

gawk -i inplace -v INPLACE_SUFFIX=.bak '{$NF="unknown" OFS $NF} 1'  Input_file | column -t