【问题标题】:How to save 2D float numpy arrays losslessly into a grayscale image while preserving resolution?如何在保持分辨率的同时无损地将 2D 浮点 numpy 数组保存到灰度图像中?
【发布时间】:2020-01-29 22:13:23
【问题描述】:

我有一些温度场值,我想将其转换为灰度图像,同时保留分辨率。 (例如,如果它是(100x100)大小的浮点数组,那么转换应该是灰度(100x100)图像)。然后我将处理图像并将其转换回温度numpy数组。图像处理部分可以被认为是一个黑盒过程。

转换无损很重要。

此外,图像处理代码将识别 .png 和 .jpg。 (我不确定对包括 tiff 在内的其他文件格式的识别。此外,即使是 jpg 格式也不是首选,因为它们会导致有损转换)。

到目前为止我的尝试:

  • Matplotlib 的 imsave() 可以保持分辨率并且是无损的。但它将图像转换为 RGB 而不是灰度。这种方法对我来说也很好,但我无法准确地将 3 通道 RGB 图像转换回浮点 numpy 数组。例如,我取了一个 10x10 的 numpy 浮点数组 temperature,使用了 plt.imsave('Temperature_profile.png',temperature)。然后,我重新打开了相同的图像,但无法找到将其转换回 (10x10) 浮点数组的准确方法。因此,如果有办法将 3 通道图像无损转换回 2D 矩阵,问题就解决了。

  • PIL 的Image.fromarray() 保留分辨率并且可以将图像保存为灰度图像。但是我无法无损地保存矩阵并无损地取回它。因此我会得到错误的结果。 (Converting 2D Numpy array of grayscale values to a PIL image)

  • scipy.misc.imsave() 已弃用。

  • imageio.imwrite() 给出关于有损转换的警告。 (“从 float64 到 uint8 的有损转换”)。

  • opencvcv2 由于某种原因无法被我的 spyder 环境(python 3.7、Anaconda 4.7.12)识别。

【问题讨论】:

  • 我的回答解决了你的问题吗?如果是这样,请考虑接受它作为您的答案 - 通过单击计票旁边的空心对勾/复选标记。如果没有,请说出什么不起作用,以便我或其他人可以进一步帮助您。谢谢。 meta.stackexchange.com/questions/5234/…
  • 嗨,对不起,我忙于其他工作。是的,你的回答对我想要的很有帮助。但同样,当我将 TIFF 图像输入图像处理代码时,它给出的结果输出图像是 uint8 格式。但这些值仅相差很小。感谢您的帮助

标签: python image


【解决方案1】:

你需要一种可以保存浮点数的无损图片格式:

  • PNG 最多只能保存 16 位整数,
  • JPEG 不是无损的,只有 8 位整数,
  • GIF 是整数和 8 位,
  • NetPBM 最多只能是 16 位整数。

所以使用具有无损压缩或不压缩的 TIFF。或者,您可以使用PFM - 便携式浮动地图。


这是一个演示:

import numpy as np
from PIL import Image

# Generate a small float image in Numpy array
grey32 = np.random.randn(2,3).astype(np.float32)                                           

# Convert to PIL Image and save
Image.fromarray(grey32).save('test.tif')                                                   

# Read back from disk and convert to Numpy array
reloaded = np.array(Image.open('test.tif'))                                                

# Inspect
print(grey32)

array([[-0.28032717, -1.7696048 , -0.9811929 ],
       [-0.7785768 , -1.2427857 , -0.33241433]], dtype=float32)

print(reloaded)                                                                           

array([[-0.28032717, -1.7696048 , -0.9811929 ],
       [-0.7785768 , -1.2427857 , -0.33241433]], dtype=float32)

如果您的查看器无法显示包含浮动的 TIFF 文件,您始终可以使用 ImageMagick 将它们转换为可查看的内容:

magick float.tif -auto-level viewable.png

我知道tifffilepyvips 都是处理 TIFF 浮点数的优秀 Python 库。

【讨论】:

  • 非常好的答案,使用这些格式轻松以 H x W 方式保存 image_depth。
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