【发布时间】:2017-12-19 18:31:02
【问题描述】:
我正在尝试将一个 400x300x60x28 的大型数据集从 Matlab(.mat 文件)作为 HDF 文件加载到 Python 中,但每次我尝试查看文件中的内容时,它都说它是空的。
到目前为止我尝试过的一些事情:
输入:
f=h5py.File(r'D:\Natalie\Research\Vascular Hand\output.mat','r')
print(f)
输出:
<HDF5 file "output.mat" (mode r+)>
输入:
store=pd.HDFStore(r'D:\Natalie\Research\Vascular Hand\output.mat')
print(store)
输出:
<class 'pandas.io.pytables.HDFStore'>
File path: D:\Natalie\Research\Vascular Hand\output.mat
Empty
输入:
f = pd.read_hdf(r'D:\Natalie\Research\Vascular Hand\output.mat')
输出:
ValueError: No dataset in HDF5 file.
这是说没有数据集,但我刚刚在 Matlab 中打开了同一个文件,它有超过 500,000 个元素。只是为了给出一些上下文,它是 Matlab 中的 4-D 单变量类型,它是通过 MRI 扫描跟踪的血液循环的到达时间数据。
【问题讨论】:
-
mat文件是否保存为7.3版本?用
h5write保存可以吗? -
是的,它是 7.3 版。我像你说的那样尝试了 h5write 将其保存为 .h5 文件,但是当我尝试将数据集读入 Python 时,它仍然将数据集识别为空。