【问题标题】：Can't Plot Dendrogram (invalid dendrogram input error)无法绘制树状图（无效的树状图输入错误）
【发布时间】：2020-02-07 10:18:24
【问题描述】：

我的数据集中有 583 个观察值，我需要使用其中的 100 个来制作树状图。但是我在 plot() 函数步骤中收到以下错误。

如何解决/解决这个问题？

##For 100 Observations
set.seed(44)
idx_100 <- sample(1:nrow(ilpd_df), 100)
distance_matrix_100 <- dist(as.matrix(ilpd_df[idx_100,-c(1,2,10,11)]), 
                        method = "euclidean") #Creates Hierarchical Clustering Solution

hc_100 <- hclust(distance_matrix_100)
plot(hc_100, hang = -1, labels=ilpd_df$Class) #CANT PLOT DUE TO INVALID INPUT ERROR

【问题讨论】：

标签： r cluster-analysis hierarchical-clustering dendrogram

【解决方案1】：

你确定你使用正确的参数来绘制你的树状图。因此，我在这里分享 S3 方法，用于在树状图上使用绘图功能。 “挂起”不包含在此列表中。

树状图的S3方法

  plot(x, type = c("rectangle", "triangle"),
  center = FALSE,
  edge.root = is.leaf(x) || !is.null(attr(x,"edgetext")),
  nodePar = NULL, edgePar = list(),
  leaflab = c("perpendicular", "textlike", "none"),
  dLeaf = NULL, xlab = "", ylab = "", xaxt = "n", yaxt = "s",
  horiz = FALSE, frame.plot = FALSE, xlim, ylim, …)

【讨论】：

【解决方案2】：

您能否提供一些可用于复制问题的最少数据？

我发现plot.hclust() 没有问题 (R 3.6.1)。

以下简单代码

hc <- hclust(dist(USArrests)^2, "cen")
class(hc)  # [1] "hclust"
plot(hc, hang = -1, main = "Sample Tree", cex = .5)

生产

【讨论】：