【发布时间】:2016-09-26 19:01:18
【问题描述】:
我尝试将我的数据拟合到泊松分布:
import seaborn as sns
import scipy.stats as stats
sns.distplot(x, kde = False, fit = stats.poisson)
但我收到此错误:
AttributeError: 'poisson_gen' 对象没有属性 'fit'
其他分布(伽马等)运行良好。
【问题讨论】:
我尝试将我的数据拟合到泊松分布:
import seaborn as sns
import scipy.stats as stats
sns.distplot(x, kde = False, fit = stats.poisson)
但我收到此错误:
AttributeError: 'poisson_gen' 对象没有属性 'fit'
其他分布(伽马等)运行良好。
【问题讨论】:
Poisson distribution(在 scipy 中实现为scipy.stats.poisson)是discrete distribution。 scipy 中的离散分布没有fit 方法。
我对@987654324@ 函数不是很熟悉,但它似乎假设数据来自连续分布。如果是这种情况,那么即使scipy.stats.poisson 有一个fit 方法,传递给distplot 也不是一个合适的分布。
问题标题是“如何用 seaborn 拟合泊松分布?”,所以为了完整起见,这里有一种方法来绘制数据及其拟合图。 seaborn 仅用于条形图,使用@mwaskom 的建议使用seaborn.countplot。拟合实际上很简单,因为泊松分布的最大似然估计只是数据的平均值。
首先,导入:
In [136]: import numpy as np
In [137]: from scipy.stats import poisson
In [138]: import matplotlib.pyplot as plt
In [139]: import seaborn
生成一些数据来处理:
In [140]: x = poisson.rvs(0.4, size=100)
这些是x 中的值:
In [141]: k = np.arange(x.max()+1)
In [142]: k
Out[142]: array([0, 1, 2, 3])
使用seaborn.countplot 绘制数据:
In [143]: seaborn.countplot(x, order=k, color='g', alpha=0.5)
Out[143]: <matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot at 0x114700490>
泊松参数的最大似然估计只是数据的平均值:
In [144]: mlest = x.mean()
使用poisson.pmf()得到预期概率,乘以数据集的大小得到预期计数,然后使用matplotlib作图。条形是实际数据的计数,圆点是拟合分布的预期计数:
In [145]: plt.plot(k, poisson.pmf(k, mlest)*len(x), 'go', markersize=9)
Out[145]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0x114da74d0>]
【讨论】:
distplot 可以显示离散分布,但可能需要调整几个参数。 countplot 可能是更好的选择(请确保使用 order=)。
countplot 生成的图。