如何在 R 的压缩文件中提取和读取 bzip2ed hdf5？

【问题标题】：How to extract and read a bzip2ed hdf5 in a zipped file in R?如何在 R 的压缩文件中提取和读取 bzip2ed hdf5？
【发布时间】：2015-08-15 17:21:31
【问题描述】：

我想读取压缩文件中的 hdf5 文件。这里的问题是这个 hdf5 文件也被双压缩为 bzip2ed (.bz2) 文件。

请参考下图。

压缩文件是"g2_BIOPAR_SWI_201012250000_GLOBE_ASCAT_V2_0_0.ZIP"。

目标bz2文件是"g2_BIOPAR_SWI_201012250000_GLOBE_ASCAT_V2_0_0.h5.bz2"。

有人可以告诉我一些提示或指导吗？

【问题讨论】：

【解决方案1】：

看看这个问题：

它解释了如何读取.bz2 文件，我认为最后一个答案适合你；或者直接输入?bzfile。之后，对于 hdf5 文件，您可以查看 Bioncoductor 的 rhdf5 包；这是链接：

【讨论】：