如何读取压缩的 DICOM 文件答案

【问题标题】：How to read compressed DICOM files如何读取压缩的 DICOM 文件
【发布时间】：2015-01-06 00:57:16
【问题描述】：

我正在寻找一种在 Java 中读取压缩 DICOM 文件的方法。 DICOM 使用 Jpeg2000 压缩。 Java 高级图像 IO 在 MAC OS 中没有库，所以我在使用使用它的 DCM4CHE 时遇到了麻烦。 ImageJ 也不支持压缩的 DICOM 文件。

File myDicomFile = new File("IM-0001-0001.dcm");
    try {
        DicomInputStream dis = new DicomInputStream(myDicomFile);
        Iterator<ImageReader> iter = ImageIO.getImageReadersByFormatName("DICOM");
        ImageReader reader = (ImageReader) iter.next();
        DicomImageReadParam param = (DicomImageReadParam) reader.getDefaultReadParam();
        ImageInputStream iis = ImageIO.createImageInputStream(myDicomFile);
        reader.setInput(iis, false);
        BufferedImage bi = reader.read(0, param);

        File myJpegFile = new File("IM-0001-0001.jpg");
        OutputStream output = new BufferedOutputStream(new FileOutputStream(myJpegFile));
        JPEGImageEncoder encoder = JPEGCodec.createJPEGEncoder(output);
        encoder.encode(bi);
        output.close();
    } catch (Exception e) {
        System.out.println(e.getStackTrace());
    }

上述代码适用于未压缩的 DICOM，但使用压缩的 DICOM 时会出现以下错误：

Exception in thread "main" java.lang.UnsatisfiedLinkError: com.sun.medialib.codec.jp2k.Decoder.decode_init(Ljavax/imageio/stream/ImageInputStream;J)J
at com.sun.medialib.codec.jp2k.Decoder.decode_init(Native Method)
at com.sun.medialib.codec.jp2k.Decoder.<init>(Decoder.java:53)
at com.sun.media.imageioimpl.plugins.jpeg2000.J2KRenderedImageCodecLib.<init>(J2KRenderedImageCodecLib.java:158)
at com.sun.media.imageioimpl.plugins.jpeg2000.J2KImageReaderCodecLib.read(J2KImageReaderCodecLib.java:367)
at org.dcm4che3.imageio.plugins.dcm.DicomImageReader.read(DicomImageReader.java:284)
at Main.main(Main.java:31)

任何建议都将不胜感激。

【问题讨论】：

标签： java macos dicom

【解决方案1】：

您可以使用 GDCM / java 绑定。请参阅以下example 以供参考。

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