R-3.2.1 无法加载共享对象 internet.so答案

【问题标题】：R-3.2.1 unable to load shared object internet.soR-3.2.1 无法加载共享对象 internet.so
【发布时间】：2015-09-30 20:35:49
【问题描述】：

将 R 从 3.1.3 升级到 3.2.1 后，我无法从 CRAN 安装软件包。错误信息是无法加载共享对象 internet.so。

install.packages("randomForest")
Installing package into ‘/gs/project/feb-684-aa/BIF/R/R-3.2.1/library’ (as ‘lib’ is unspecified)
--- Please select a CRAN mirror for use in this session ---
Error in url("http://cran.r-project.org/CRAN_mirrors.csv") : 
  internet routines cannot be loaded
In addition: Warning message:
In url("http://cran.r-project.org/CRAN_mirrors.csv") :
  unable to load shared object '/software/areas/ircm/tools/R-3.2.1/lib64/R/modules//internet.so':
  /software/areas/ircm/tools/R-3.2.1/lib64/R/modules//internet.so: undefined symbol: curl_multi_wait
> sessionInfo()
R version 3.2.1 (2015-06-18)
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)
Running under: CentOS release 6.5 (Final)

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_CA.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
 [3] LC_TIME=en_CA.UTF-8        LC_COLLATE=en_CA.UTF-8    
 [5] LC_MONETARY=en_CA.UTF-8    LC_MESSAGES=en_CA.UTF-8   
 [7] LC_PAPER=en_CA.UTF-8       LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=en_CA.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] nvimcom_0.9-8

loaded via a namespace (and not attached):
[1] tools_3.2.1

[blancha@lg-1r17-n04 BIF]$ ls /software/areas/ircm/tools/R-3.2.1/lib64/R/modules//internet.so -l
-rwxrwxr-x 1 blancha feb-684-01 275221 Jul 12 09:47 /software/areas/ircm/tools/R-3.2.1/lib64/R/modules//internet.so

以下帖子似乎解决了类似的问题。 Error in install.packages: internet routines cannot be loaded using StatET while it works in R console

【问题讨论】：

你是如何安装 R 的？通过官方软件包存储库？您安装的 R 版本似乎与安装的 curl 版本不兼容。更具体地说，R 需要一个 curl 函数 curl_multi_wait，这似乎是在 2013 年左右在 curl 中引入的。您的 curl 版本可能比这更旧。
curl/libcurl 的最低版本应为 7.28.0，根据 documentation。你安装的是哪个版本的？
我安装了 curl 7.35 版。我更新到 7.43，并重新安装了 R-3.2.1。我仍然得到完全相同的错误版本。 R-3.2.1 是从 CRAN 下载的。我是从源包安装的。 wgetcran.utstat.utoronto.ca/src/base/R-3/R-3.2.1.tar.gz
wget cran.utstat.utoronto.ca/src/base/R-3/R-3.2.1.tar.gz tar xzvf R-3.2.1.tar.gz;mv R-3.2.1 build; mkdir R-3.2.1 配置 --prefix=/software/areas/ircm/tools/R-3.2.1;make;make install
[blancha@lg-1r17-n03 build]$ curl --version curl 7.43.0 (x86_64-unknown-linux-gnu) libcurl/7.43.0 OpenSSL/1.0.1e zlib/1.2。 3 libidn/1.18

标签： r installation package cran

【解决方案1】：

已修复！感谢@David Robinson 的建议。他们让我走上了正轨。

我刚刚将以下命令添加到我的.bash_profile，问题就解决了：

export LD_LIBRARY_PATH=$TOOLS/curl-7.43.0/lib:$LD_LIBRARY_PATH

【讨论】：