使用sigma和pair的方法sum的python含义

Question

我正在尝试了解 Internet 上提供的代码

但我是python新手，无法得到这行代码：

score = sum([-sigma if '-' in pair else scoring_matrix[pair] for pair in zip(v_aligned, w_aligned)])

我知道方法总和，作为单独的方法 但我不明白括号内发生了什么

v_aligned, w_aligned 是两个对齐的字符串，例如如果 v=PLEASANTLY 和 w=MEANLY

v_aligned= LEASNT-LY w_aligned= MEA-N-LY-

scoring_matrix 是 BLOSUM62

sigma=5

Answer 1

让我们先谈谈你表情中的拉链 它将从您的两个变量中“配对”值，这意味着它将返回一个 zip 对象，如果您遍历该对象，它将像这样返回 ('L', 'M'), ('E', 'E'), ( 'A', 'A'), ('S', '-') 等等。 如您所见，它遍历您的“单词”的字母，并将第一个单词中的一个字母匹配到第二个单词中的另一个“字符”。

for 循环将逐步遍历您通过该 zip 对象提供的每个元组，pair 指的是当前元组。

不，那我们有-sigm if '-' in pair else scoring_matrix[pair]

很简单 - 这是一个条件：如果 '-' 在当前对中，例如让我们取 ('L', 'M')，然后将 -sigma 放入此表中，如果不是，则把 scrring_matrix[pair] 的结果放在那里。如您所见，'-' 不在 ('L', 'M') 中，所以它会将scoring_matrix[pair] 放在那里。