conda activate 命令在 mac 上不起作用

Question

我有 miniconda 4.8.3 + MacOS Catalina 10.15。我可以在终端手动激活 conda 环境并启动一个 spyder 会话。

$ ~/miniconda3/bin/conda activate py3
$ ~/miniconda3/bin/conda info | grep "active environment"
$ spyder &

当我将上述内容放入脚本时，run_spyder.sh 无法正常工作，并抱怨“CommandNotFoundError：您的 shell 未正确配置为使用 'conda activate'。”

#!/bin/bash
# run_spyder.sh
~/miniconda3/bin/conda activate py3
~/miniconda3/bin/conda info | grep "active environment"  # still print base
# spyder &

我尝试了bash -i ./run_spyder.sh、source ./run_spyder.sh 或添加~/miniconda3/bin/conda init bash 之类的替代方法，但都不起作用。

shell还是bash，没有.bashrc，在.bash_profile这个是miniconda安装自动生成的脚本

# .bashrc_profile
# >>> conda initialize >>>
# !! Contents within this block are managed by 'conda init' !!
__conda_setup="$('~/miniconda3/bin/conda' 'shell.bash' 'hook' 2> /dev/null)"

if [ $? -eq 0 ]; then
    eval "$__conda_setup"
else
    if [ -f "~/miniconda3/etc/profile.d/conda.sh" ]; then
        . "~/miniconda3/etc/profile.d/conda.sh"
    else
        export PATH="~/miniconda3/bin:$PATH"
    fi
fi
unset __conda_setup
# <<< conda initialize <<<

Answer 1

conda activate 函数是一个 shell 函数，通常在会话开始时在 shell 的初始化文件中定义（例如，在 .bash_profile 中）。 conda init 函数只是将代码添加到此类初始化文件中，但不会实际获取它添加的代码。希望这可以澄清问题（和 cmets）中尝试的困难。

请尝试直接采购 Conda 使用的代码。比如：

#!/bin/bash
source ~/miniconda3/etc/profile.d/conda.sh
conda activate py3
conda info | grep "active environment"
spyder &

另一种选择是让bash（或zsh）会话在登录模式下启动（即为当前用户运行初始化文件）。

#!/usr/bin/env bash -l
conda deactivate    # <- may not be needed, but didn't work for me without
conda activate py3
conda info | grep "active environment"
spyder &

但是，请注意，在后一种情况下，我发现我需要首先包含 conda deactivate，以便 conda activate 正确地优先考虑 PATH 上的环境中的 Python。