如何在文本文件中编写一个 numpy 矩阵 - python答案

【问题标题】：How to write a numpy matrix in a text file - python如何在文本文件中编写一个 numpy 矩阵 - python
【发布时间】：2014-04-02 20:11:53
【问题描述】：

假设我从一些计算中得到一个 numpy 矩阵。这是我的 numpy 矩阵 'result1'::

    result1=
    [[   1.         0.         0.         0.00375   -0.01072   -0.      -1000.     ]
     [   2.         3.         4.         0.        -0.004    750.         0.     ]
     [   3.         3.         0.         0.         0.      -750.      1000.     ]]

现在我想将这个矩阵写入一个名为“result.txt”的文本文件中。为此，我编写了以下代码：：

np.savetxt('result.txt', result1, fmt='%.2e')

但它在一行中给了我矩阵的所有元素。

    1.00e+00 0.00e+00 0.00e+00 3.75e-03 -1.07e-02 -1.14e-13 -1.00e+032.00e+00 3.00e+00 4.00e+00 0.00e+00 -4.00e-03 7.50e+02 0.00e+003.00e+00 3.00e+00 0.00e+00 0.00e+00 0.00e+00 -7.50e+02 1.00e+03

我想以正确的矩阵格式在文本文件中写入矩阵。我怎样才能做到这一点？我用了关键字newline='\n'或者newline=''，但是结果是一样的。

提前谢谢...

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这个编辑的部分是给@Warren的

试试这个：

>>> import numpy as np
>>> mat=np.matrix([[1, 2, 3],[4, 5, 6],[7, 8, 9]])
>>> mat
matrix([[1, 2, 3],
        [4, 5, 6],
        [7, 8, 9]])
>>> np.savetxt('text.txt',mat,fmt='%.2f')

在我的 text.txt 文件中，我得到：

1.00 2.00 3.004.00 5.00 6.007.00 8.00 9.00

【问题讨论】：

可能重复：stackoverflow.com/questions/3685265/…
我无法重现这个。如果我给savetxt 提供一个二维数组（或np.matrix），它会为数组的每一行创建一个文件。您能否创建一个完整的最小示例，我们可以运行它来提供单行文件？
[此评论是对已删除评论的回复。]您的示例对我来说按预期工作（使用 numpy 1.7.1 和 1.8.0）。您如何查看文件“text.txt”？我怀疑您显示的输出中在 3.00 和 4.00 之间以及 6.00 和 7.00 之间缺少空格。您在问题中的示例输出也缺少行分隔符所在的空格。（另外，你在什么操作系统上运行它？可能没关系，但知道它不会有坏处。）
@WarrenWeckesser，请检查编辑部分。
这看起来很相关，虽然它只提到了 python 2.7：github.com/numpy/numpy/pull/3976（拉取请求）和github.com/numpy/numpy/issues/3975（错误报告）。

标签： python numpy matrix text-files

【解决方案1】：

如果你只想使用numpy:

import numpy as np

mat = np.matrix([[1, 2, 3], [4, 5, 6], [7, 8, 9]])
with open('outfile.txt') as f:
    for line in mat:
        np.savetxt(f, line, fmt='%.2f')

然后

cat outfile.txt
1.00 2.00 3.00
4.00 5.00 6.00
7.00 8.00 9.00

Pandas 有to_csv 方法：

import numpy as np
import pandas as pd

mat = np.matrix([[1, 2, 3], [4, 5, 6], [7, 8, 9]])
df = pd.DataFrame(data=mat.astype(float))
df.to_csv('outfile.csv', sep=' ', header=False, float_format='%.2f', index=False)

它具有相同的输出：

cat outfile.csv
1.00 2.00 3.00
4.00 5.00 6.00
7.00 8.00 9.00

【讨论】：

【解决方案2】：

和 Francesco Nazzaro 的回答一样，但为了确保文件可以成功打开有点不同，试试：

a = np.array([[1, 2, 3], [4, 5, 6], [7, 8, 9]])
mat = np.matrix(a)
with open('outfile.txt','wb') as f:
    for line in mat:
        np.savetxt(f, line, fmt='%.2f')

【讨论】：

【解决方案3】：

要重新创建形状，您需要在保存文件时保存形状。

试试：

import numpy as np
import re

result=np.array([[1.,0.,0.,0.00375,-0.01072,-0.,-1000.,],
                 [2.,3.,4.,0.,-0.004,750.,0.],
                 [3.,3.,0.,0.,0.,-750.,1000.]])

with open('/tmp/test', 'w') as fout:
    fout.write(u'#'+'\t'.join(str(e) for e in result.shape)+'\n')
    result.tofile(fout)

with open('/tmp/test', 'rb') as f:
    line=f.readline().decode('ascii')
    if line.startswith('#'):
        shape=tuple(map(int, re.findall(r'(\d+)', line)))
    else:
        raise IOError('Failed to find shape in file')    

    result2=np.fromfile(f)
    result3=result2.reshape(shape)

print(np.array_equal(result, result2))
# False
print(np.array_equal(result, result3))
# True

您可以将形状以某种形式保存在文件中，以便重新创建相同的形状。但请确保不要忘记文件开头的数据，因为与np.loadtxt 不同，以# 开头的行仍被视为数据。

【讨论】：