R颜色顶点按列答案

【问题标题】：R color vertices by columnR颜色顶点按列
【发布时间】：2013-07-11 09:23:13
【问题描述】：

我正在使用 iGraph 来绘制图表。我的矩阵中只有两列 - A 和 B。我需要用两种颜色为节点着色 - 这表示属于 A 的节点和属于 B 的节点。例如：

# k is a df with 2 columns – A and B
k_mx <- as.matrix(k)
k_mx_g <- graph.edgelist(k_mx, directed = FALSE)
V(k_mx_g)$color = ?? ( want blue for A and red for B)

请告诉我该怎么做。

谢谢， PD

【问题讨论】：

标签： r colors igraph vertices

【解决方案1】：

假设这个数据框：

k <-     structure(list(A = 1:4, B = 5:8), 
                 .Names = c("A", "B"), row.names = c(NA, -4L),
                  class = "data.frame")

...您可以将rep 与each 参数一起使用。否则，由于参数循环，它们将被依次标记为 c("blue," "red", "blue", "red", "blue", "red", "blue", "red")：

V(k_mx_g)$color <- rep(c("blue", "red"), each=4)

Gabor 的评论让我提供了这个选项，这似乎更笼统：

V(k_mx_g)[k$A]$color <- "blue"
V(k_mx_g)[k$B]$color <- "red"

【讨论】：

不幸的是，如果这有效，那么它只是偶然有效，因为第一列中有 1:4，第二列有 5:8。
这确实是作为一个 data.frame 开始的，它正在通往矩阵的路上。我们被引导相信第一列的所有内容都是“A”，需要分配给“蓝色”，而第二列的所有内容都应该分配给“红色”。该过程涉及多少机会？
嗯，我认为“另一个选项”是正确的，但您必须小心数据框中的数字，否则您将使用因子进行索引。此外，显然，这仅适用于图是二分图的，即 A 列中的顶点没有出现在 B 列中，但我猜张贴者有这样的图，否则这个问题没有意义。
DWin：评论不是正确回答这个问题的一种非常方便的方式，但你怎么能确定顶点 1:4 在他的第一列？也许我在这里遗漏了一些东西，不幸的是，海报没有提供任何数据来确定。
我一定遗漏了一些东西，因为我认为使用数据框列值可以解决任何歧义。