使用 igraph 和 R 进行图形可视化答案

【问题标题】：Graph Visualization with igraph and R使用 igraph 和 R 进行图形可视化
【发布时间】：2013-07-28 00:10:38
【问题描述】：

我正在尝试使用 igraph 包在 R 中可视化图形。我希望可视化边缘大小在 2000 到 70,000 之间的图形。情节如下所示：

这不是一个很好的情节，因为你什么都看不到。我已经想出了如何去掉标签，但你仍然看不到任何东西，因为顶点太大了。

例如，这里是相同的情节，但我在完成之前拍了照片。似乎 R 只在完成之前绘制边缘：

【问题讨论】：

【解决方案1】：

您可以将顶点大小设置为 0。

library(igraph)
g <- barabasi.game(100)
plot( g, vertex.size=0, vertex.label=NA, edge.arrow.size=0 )

【讨论】：

是否有不同的布局算法可以指定？我试了一下，这正是我想要的（奇怪的是不在文档中）。它看起来不像我上面的图片。
该图是使用该代码生成的，仅此而已。大多数参数都列在?igraph.plotting 中，但必须以vertex. 或edge. 为前缀。根据您的图表，默认布局可能不是最佳选择（我的示例是一棵树——这更容易绘制）：您可以查看 ?layout 以获取完整的布局算法列表。为了绘制大图，很多人使用Gephi，它（是交互式的）可能更灵活。
使用vertex.size=0 igraph 仍然会绘制一些非常小的顶点。最好将形状设置为none:plot(..., vertex.shape="none", vertex.size=0)。