ggplot2 显着性水平，带星号，调整后的 p 值答案

【问题标题】：ggplot2 significance level with asterisk with adjusted p valuesggplot2 显着性水平，带星号，调整后的 p 值
【发布时间】：2020-06-19 09:35:46
【问题描述】：

我是 R 的初学者，我想知道是否可以在使用 ggplot2 包的数据可视化方面获得一些帮助。

我正在尝试使用调整后的 p 值（使用 Bonferroni 校正）而不是带有星号的正常 p 值来标记显着性水平。

我试过的代码是……

stat_compare_means(aes(label=..p.adj.., group=sample_type), label = "p.signif", method = "t.test", hide.ns = TRUE)

stat_compare_means(aes(group=sample_type), p.adjust.method = "bonferroni", label = "p.signif", method = "t.test", hide.ns = TRUE)

【问题讨论】：

如果您包含一个简单的reproducible example，其中包含可用于测试和验证可能解决方案的示例输入和所需输出，则更容易为您提供帮助。

标签： r ggplot2 statistics p-value

【解决方案1】：

请参阅EnvStats 包。 example provided by the authors（第 1180 页）是：

library(ggplot2)
library(EnvStats)
p <- ggplot(mtcars, aes(x = factor(cyl), y = mpg, color =     
factor(cyl))) + theme(legend.position = "none")

dev.new()
p + geom_point() +
stat_n_text() + stat_mean_sd_text() +
stat_test_text() +
labs(x = "Number of Cylinders", y = "Miles per Gallon")

【讨论】：