R中igraph中的R倒数边答案

【问题标题】：R reciprocal edges in igraph in RR中igraph中的R倒数边
【发布时间】：2011-08-08 08:47:42
【问题描述】：

我正在使用 R 中的图形。我目前正在使用 igraph，我希望能够绘制图形的双向边“互易边”。到目前为止，我已经看到可以绘制“双向”图，但不能绘制倒数边，例如：E(1,3) 和 E(3,1) 可能表示为双向边，但是相反，我想绘制两条平行边，一条指向另一条的相反方向|| . 在绘制“plot(rEG, recipEdges = "distinct")" 时，Rgraphviz 中有一个选项可以做到这一点，但我更喜欢 igraph 上的绘图。提前致谢。

【问题讨论】：

标签： r graph nodes bidirectional igraph

【解决方案1】：

在igraph中，你可以使用边缘属性curved来弯曲你想要的边缘。

例如，这是一个基于图的小邻接矩阵：

library("igraph")
adj <- matrix(c(
    0,1,1,
    1,0,1,
    0,0,0),3,3,byrow=TRUE)

library("igraph")
G <- graph.adjacency(adj)

节点 0 和 1 之间的边是双向的（实际上不是，它是两条边，它们看起来像双向边，因为它们是直的）。：

plot(G)

要改变这一点，我们可以使用 edgelist：

E <- t(apply(get.edgelist(G),1,sort))

E(G)$curved <- 0
E(G)[duplicated(E) | duplicated(E,fromLast =TRUE)]$curved <- 0.2

plot(G)

另一个选项是我的包，这是默认行为：

library("qgraph")
qgraph(adj)

可以使用bidirectional 参数抑制。

【讨论】：

非常感谢，我看到你甚至可以设置平行边之间的分隔，太棒了。

【解决方案2】：

试试plot(graph, edge.curved=TRUE)。它肯定适用于 igraph 0.6，也可能适用于 igraph 0.5.4（不确定何时添加）。

【讨论】：

这太棒了，我喜欢@sachaepskamp 的回答是你可以修改边之间的分离，这要归功于两者。