Fedora 28 上的 RMySQL 安装错误答案

【问题标题】：RMySQL installing error on Fedora 28Fedora 28 上的 RMySQL 安装错误
【发布时间】：2018-12-19 04:16:19
【问题描述】：

我已经看过这个RMySQL installing error on Fedora 28, Rstudio version 1.1.4,问答，但我没有这个问题。

我正在使用

安装 MySQL

R CMD INSTALL /home/Trina/Downloads/RMySQL_0.10.14.tar.gz

我得到了：

安装到库 '/home/Trina/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.5'

正在安装源代码包'RMySQL' ... ** 包‘RMySQL’成功解包并检查MD5总和找到 mysql_config cflags 和库！使用 PKG_CFLAGS=-I/usr/include/mysql -m64 使用 PKG_LIBS=-L/usr/lib64/mysql -lmysqlclient -lpthread -lm -lrt -lssl -lcrypto -ldl ** 库 rm -f RMySQL.so RMySQL-init.o connection.o db-apply.o driver.o exception.o fields.o result.o utils.o gcc -m64 -I"/usr/include/R" -DNDEBUG -I/usr/include/mysql -m64 -I/usr/local/include -fpic -O2 -g -pipe -Wall -Werror=format-security - Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wp,-D_GLIBCXX_ASSERTIONS -fexceptions -fstack-protector-strong -grecord-gcc-switches -specs=/usr/lib/rpm/redhat/redhat-hardened-cc1 -specs=/usr/lib/ rpm/redhat/redhat-annobin-cc1 -m64 -mtune=generic -fasynchronous-unwind-tables -fstack-clash-protection -fcf-protection -c RMySQL-init.c -o RMySQL-init.o gcc -m64 -I"/usr/include/R" -DNDEBUG -I/usr/include/mysql -m64 -I/usr/local/include -fpic -O2 -g -pipe -Wall -Werror=format-security - Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wp,-D_GLIBCXX_ASSERTIONS -fexceptions -fstack-protector-strong -grecord-gcc-switches -specs=/usr/lib/rpm/redhat/redhat-hardened-cc1 -specs=/usr/lib/ rpm/redhat/redhat-annobin-cc1 -m64 -mtune=generic -fasynchronous-unwind-tables -fstack-clash-protection -fcf-protection -c connection.c -o connection.o connection.c：在函数“RS_MySQL_moreResultSets”中： connection.c:224:3：错误：未知类型名称“my_bool”；您指的是 “bool” 吗？ my_bool tmp; ^~~~~~~ 布尔 make: *** [/usr/lib64/R/etc/Makeconf:159: connection.o] 错误 1 错误：包“RMySQL”编译失败

删除“/home/Trina/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.5/RMySQL”

我在 Rstudio 中使用 install.packages 时遇到了同样的问题。感谢社区提供的任何帮助。

【问题讨论】：

我的猜测是您缺少依赖项。您是否尝试过搜索例如“rmysql fedora r”？
在 Debian 上，适用于许多有问题的软件包的方法是将它们安装在 R 中而不是作为 Debian 软件包（使用 apt-get install）。显然，这只有在存在这样的 Debian 软件包时才有效。困难可能是安装需要一些外部工具，例如编译器，而 R 不容易找到它们。另一个潜在的困难来源是您的 mysql 安装，例如必须与您的 r 安装匹配的 32 位与 64 位架构
我在 Ubuntu 18 上也遇到了同样的错误。似乎找不到任何解决方案。

标签： mysql r rmysql

【解决方案1】：

此错误与安装在 linux 中的 mysql >= 8.0 有关。

根据下面的 mysql 网站，从 MySQL 8.0 开始，my_bool 类型被替换为 bool 或 int C 类型。

（在下面的 URL 中使用 Ctl+F 并搜索 my_bool 关键字直接进入更新）

https://dev.mysql.com/doc/refman/8.0/en/c-api-data-structures.html

解决问题的方法

解压 RMySQL tar 文件并在 src 文件夹下查找 connection.c 文件。

在connection.c 文件中，只需将my_bool 替换为bool 类型即可。之后，tar 已修改 connection.c 文件的 RMySQL 文件夹，并使用此更新的 RMySQL tar 文件使用 R CMD INSTALL 进行安装。

请尝试上述方法，如果它解决了问题，请告诉我。

【讨论】：