在 Lyx 中使用 Knitr 的 R 函数出错答案

【问题标题】：Error with R function using Knitr in Lyx在 Lyx 中使用 Knitr 的 R 函数出错
【发布时间】：2012-09-09 00:49:54
【问题描述】：

使用 summary() 函数时出现错误 Lyx 的针织衫。它前面的功能有效。

<<>>=
library(faraway)
head(teengamb)
mdl <- lm(gamble ~ sex + status, data=teengamb) 
summary(mdl)
@

我正在通过在 Lyx 中插入 Tex 代码输入此代码。我刚刚测试我可以运行摘要（teengamb）但不能运行摘要（mdl）。两种代码都可以在 RStudio 中使用。

错误是“未定义的控制序列”，描述为“\end{verbatim} ...”

【问题讨论】：

您能更具体地说明您遇到的错误吗？如果您将其单独放入 Lyx 文档，您会收到错误消息吗？
我没有说具体，我更新了我的帖子以包含更多细节。
抱歉，我无法复制您的问题；我在 Ubuntu 上运行 Lyx 2.0.4。您是否尝试过将代码标记为 Sweave 块（使用下拉样式）而不是使用 Insert > Tex Code？你使用的是什么版本的 Lyx 等以及什么操作系统？
我在 Mac 上使用 Lyx 2.0.4。我只是尝试了 Sweave，它起作用了，我猜我只是 knitr 有问题。
为了跟进@mrdwab 的评论，他的建议也对我有用，但我必须确保将 Rnw(knitr) 移至 Document > Settings > Modules 下的“Selected”列。

标签： r latex knitr lyx

【解决方案1】：

这个问题已经在knitr 1.1 之后的版本中解决了。您无需更改 LyX 或 R 中的任何内容。从 CRAN 安装 knitr：

install.packages('knitr')

请忽略以下两个答案：

我终于找到了这个错误的原因（这是我见过的最深的错误）。这是因为upquote包如果在加载后声明T1编码就不起作用，例如

\documentclass{article}
\usepackage{upquote}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage[latin9]{inputenc}
\begin{document}
\begin{verbatim}
'
\end{verbatim}
\end{document}

但是如果我们在fontenc 之后移动upquote，它会起作用：

\documentclass{article}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage[latin9]{inputenc}
\usepackage{upquote}
\begin{document}
\begin{verbatim}
'
\end{verbatim}
\end{document}

或者只是不使用 T1 编码 -- 在首选项中取消选中字体编码之前的复选框：

Ubuntu 用户无法重现该问题的原因是，upquote.sty 来自 R 的 texmf 树，而不是 TeXLive 中的树，而 R 的 upquote 版本有效。

解决问题的另一种方法是将R的texmf树添加到Windows下的MikTeX中。

请忽略下面的答案：

由于options(show.signif.stars = FALSE) 工作，我将它作为一个可能的答案发布，但这对我来说仍然是一个非常奇怪的问题。设置show.signif.stars = FALSE 会从以下结果中删除重要代码（来自summary(mdl)）：

Call:
lm(formula = gamble ~ sex + status, data = teengamb)

Residuals:
    Min      1Q  Median      3Q     Max 
-35.873 -15.755  -3.007  10.924 111.586 

Coefficients:
            Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)    
(Intercept)  60.2233    15.1347   3.979 0.000255 ***
sex         -35.7094     9.4899  -3.763 0.000493 ***
status       -0.5855     0.2727  -2.147 0.037321 *  
---
Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1 

Residual standard error: 27.99 on 44 degrees of freedom
Multiple R-squared: 0.2454, Adjusted R-squared: 0.2111 
F-statistic: 7.154 on 2 and 44 DF,  p-value: 0.002042

错误来自Signif. codes 行，我不明白为什么这些字符中的任何一个都可能导致 LaTeX 中的错误：它们都是 ASCII 并且应该在 verbatim 环境中工作。

从上面的 cmets 中，@mrdwab 和我都无法重现该问题。我想 OP 的 LaTeX 安装一定有什么奇怪的地方。

【讨论】：