带有 install.packages 行的错误 R Studio Knit HTML答案

【问题标题】：Error R Studio Knit HTML with install.packages line带有 install.packages 行的错误 R Studio Knit HTML
【发布时间】：2015-09-06 17:13:07
【问题描述】：

我是 RStudio 的新用户，在使用 .rmd 文件和 Knit HTML 时遇到错误

如果我有 install.packages 行：

install.packages('ggplot2');
library(ggplot2);

当我点击 Knit HTML 时，返回错误：

contrib.url(repos, "source") 中的错误：尝试在没有 CRAN 的情况下使用设置镜像调用： ... withVisible -> eval -> eval -> install.packages -> contrib.url 执行停止

我能够使用以下方法解决此问题：

if (!require('ggplot2')) 
{
  install.packages('ggplot2');
  library(ggplot2);
}

如果我正在编写 .rmd，是否每次安装新软件包时都需要使用 if (!require( 行？有没有办法避免这种情况，所以我只能写install.packages(？

【问题讨论】：

您是否尝试过类似：install.packages("ggplot2", repos = 'http://cran.us.r-project.org')?
为什么需要install.packages 行？每次编译 Rmd 时，您真的要重新安装软件包吗？通常你会在一个单独的交互式会话中安装这些包，然后在你的 Rmd 中使用library。
正如@hrbrmstr 建议的那样，如果您设置repos 参数，效果很好，我刚刚测试过。
我并不总是设置 CRAN 镜像。当我这样做时，我设置了云镜像cran.rstudio.com :)
谢谢 hrbrmstr 和 yihui，您的两个建议都很有效！是否可以将 cran.rstudio.com 设置为默认值？还是每次都需要写在代码里？

【解决方案1】：

您不需要每次都使用install.package() 行。

通常您应该在控制台或单独的交互式会话中安装软件包，或者在安装该库后删除该行（这里是 ggplot）。

只需使用库（ggplot2）

  library(ggplot2);

希望对你有帮助

【讨论】：

【解决方案2】：

我在使用 Knit 文档时也遇到了同样的错误，我在 R 脚本中做了以下事情：

【讨论】：