系统 R 命令和 shell 输出不同

Question

我的系统中安装了 ubuntu 的默认 python 和 Anaconda Python。当我在 R 中运行系统命令时：

> system('which python')
/usr/bin/python

但是从外壳：

user@user:~/Documents/Rad/jee/Solver$ which python
/home/user/anaconda2/bin/python

同样来自 Rscript 命令行模式：

user@user:~/Documents/Rad/jee/Solver$ Rscript -e "system('which python')"
/home/user/anaconda2/bin/python

R 系统命令中可能有什么不同以提供不同的输出。

Answer 1

经过一些调试，我在 Anaconda 在 PATH 中添加 python 可执行路径的方式中找到了答案。 Anaconda 将它添加到 .bashrc 中，该 .bashrc 仅在 bash 中可用，因此当我在终端中执行任何操作时可以看到它。但是，看起来 R 系统命令会进行 sh 调用。所以anaconda python在R系统命令输出中不可用。

将 anaconda 设置从 .bashrc 移动到 .profile 文件后；问题解决了。