在 Anaconda Jupyter 笔记本中为 RKernel 指定 R 库路径答案

【问题标题】：specifying R library path for RKernel in Anaconda Jupyter notebook在 Anaconda Jupyter 笔记本中为 RKernel 指定 R 库路径
【发布时间】：2016-01-31 06:07:34
【问题描述】：

首先让我先声明一下，我是 R 新手，但我是 Python 的资深用户。鉴于我喜欢 conda 生态系统和 Jupyter notebook，我也尝试将它们设置为我的 R 开发环境。

因此，使用https://www.continuum.io/blog/developer/jupyter-and-conda-r 处的说明，我已经设置了一个 Jupyter Notbook，它使用 RKernel，它应该会安装在我的 Anaconda 文件夹中安装的 R（无论如何我都会这么想）。

设置起来很容易，一切都适用于标准 R 东西，但我的分析需要一些 R 库，这些库在 r-essentials 频道中不可用。没问题，我想我知道如何安装 R 库。我转到“C:\Anaconda\R\bin\x64\Rgui.exe”并安装 rgdal、dismo 和其他一些软件包。为了检查我的工作，我在 C:\Anaconda\R\library 中查看了它们。

但是当我从 Anaconda 命令提示符运行 jupyter notebook 时。并启动一个新的 R 笔记本我得到一个“库中的错误（dismo）：没有名为'dismo'的包”等一下，我从笔记本运行“.libPaths（）”，它看起来像它的指向

【问题讨论】：

标签： r windows anaconda

【解决方案1】：

您可以在笔记本开头的代码单元格中添加.libPaths('path_where_your_packages_are')，以告诉 jupyter 您的包在哪里。对我来说那是.libPaths('~/R/win-library/3.2')（来自在github上提交this issue的discnerd的解决方法）。

要找出包的路径，只需在 R 中安装一个随机包，然后等待将位置打印到控制台。

更多详细信息（可能特定于我的系统/安装）：在 R 中运行 .libPaths() 时，我得到了 2 个位置：一个需要管理员权限才能编写，一个不需要管理员权限来编写。虽然通过 R 安装的软件包位于不需要管理员权限的位置，但 jupyter 会查看需要管理员权限的位置。

【讨论】：

我遇到了类似的问题：here。当我运行libPaths时，我有 3 条不同的路径。尝试您的解决方案后，我仍然无法在 Anaconda 中访问我的包。您是否听说过有关此类问题的任何新信息？

【解决方案2】：

你可以通过installed.packages()找到你的图书馆的路径

【讨论】：