tbl_summary 和数值变量

Question

tbl_summary [library (gtsummary)] 不会以相同的方式处理所有数值变量，我不知道如何更改它。例如。

mtcars 只有数字变量，所以当我运行它时，我希望计算每个变量的平均值。相反，它将 cyl、gear 和 carb 视为分类。

tbl_summary(mtcars, statistic = list(all_numeric() ~ "{mean} ({sd})",
                                      all_categorical() ~ "{n} / {N} ({p}%)"))

我实际上有一个更大的数据集，并且 tbl_summary 将一些数值变量视为分类变量。会不会是因为 N 太少（假设我有很多缺失的行）而 tbl_summary 不想计算如此小的 N 的平均值？

我无法想象这个！

只是我数据中的另一个例子。 Q12_5_TEXT 是一个数值变量，但这是 tbl_summary 的输出。

Answer 1

我试过type = all_continuous() ~ "continuous2"，我的版本是1.3.5，并没有改变摘要类型：

library(tidyverse)
library(gtsummary)

nrows <- 30

df <- tibble(
  a = sample(c(0,1,3.5,7.5),nrows,replace = T),
  b = sample(c("Group I","Group II"),nrows,replace = T)
)

df %>% 
  tbl_summary(
    by = b,
    type = all_continuous() ~ "continuous2",
    statistic = all_continuous() ~ "{mean} ({sd})"
  )

这个汇总变量“a”的输出就好像它是一个分类变量，尽管有类型参数。我也遇到了这个问题，这就是我来这里寻求答案的原因。如果我应该使用不同的论点，您可以指出我，我将不胜感激！

Answer 2

对具有很少唯一级别的变量进行分类汇总。例如，mtcars$cyl 只有三个唯一级别：4、6、8。只有三个级别，分类摘要比平均值或中位数更合适。

使用type= 参数更改默认摘要类型。