使用 CygWin 从 Shell 运行 R 脚本：错误“未找到 Rscript”

Question

这是我第一次尝试从 CygWin 终端运行 R 文件。 我有一个名为 linreg.R 的文件，我与 CygWin 终端中的文件位于同一目录中。 在同一目录中有一个 shell 脚本，它接收输入 linreg.R 和另一个 data.txt（位于其他地方）。

当我使用适当的输入运行 bash 时，它一次又一次地给我同样的错误：

$ ./build_model_from_directory.sh linreg.R /workdir/workdir/prod_data_v.txt lm_try
./build_model_from_directory.sh: line 27: type: Rscript: not found
Rscript is needed for linreg.R. Exiting

当我这样写的时候：

$./build_model_from_directory.sh linreg.Rscript /workdir/workdir/prod_data_v.txt lm_try
Script assumes linreg.Rscript in same directory

这是 linreg.R 的第一行

#!/usr/bin/env Rscript

我尝试将路径设置为PATH=$PATH:C:\\ProgramFiles\\R\\R-3.0.1\\bin 但没有用。它已经更改了 PATH，但脚本仍然没有运行。

任何帮助将不胜感激。

Answer 1

将它添加到您的 .bashrc 文件中可能值得您花时间：

echo 'PATH=$PATH:/cygdrive/c/Program\ Files/R/R-3.2.3/bin' >> .bashrc

Answer 2

我一次又一次地发现了自己犯的错误。

cygpath 用于查找 UNIX 环境中目录路径的实际表示

例子：

$ cygpath 'C:\Program Files\R\R-3.0.1\bin'
/cygdrive/c/Program Files/R/R-3.0.1/bin

所以我们需要确保 PATH 变量具有Program Files 而不是ProgramFiles。 由于 UNIX 不理解特殊字符，我们需要将 Program Files 之间的空格倒转

 $ PATH=$PATH:/cygdrive/c/Program\ Files/R/R-3.0.1/bin

之后它开始识别 R 文件。