Rpy2 - 数据框列表列表

Question

我正在尝试弄清楚如何使用 python 将文件从 XML 文件解析为数据结构以传递给 R。

我需要在 R 中创建一个数据框列表：

Nodes = data.frame()
Edges = data.frame()

NetworkCompListA = list()
NetworkCompListA[['Nodes']] = Nodes
NetworkCompListA[['Edges']] = Edges

Networks = list()
Networks[['NetA']] = NetworkCompListA
Networks[['NetB']] = NetworkCompListB

我知道如何根据 Rpy2 文档中的示例创建数据框。

import rpy2.rlike.container as rlc
od = rlc.OrdDict([('value', robjects.IntVector((1,2,3))),
                      ('letter', robjects.StrVector(('x', 'y', 'z')))])
df = robjects.DataFrame(od)

如何将 'df' 插入到列表中，然后将该列表插入到 python 中的另一个列表中，然后将其写入 rdata 文件以加载到另一个 R 实例中？

谢谢！

Answer 1

ListVector 类需要实现iteritems() 的对象（例如dict 或OrderedDict）。请注意，在 R 中，data.frames 只是具有（松散）约束的列表，即所有元素都应该是相同长度的向量（或者可以接受具有匹配行数的矩阵），并且具有行名和列名（列表的名称是列名）。

from rpy2.robjects.vectors import ListVector, DataFrame

# rpy2's OrdDict was added because there was no ordered dict
# in Python's stdlib. It should be gone by rpy2-2.5
from collections import OrderedDict

od = OrderedDict((('a', 1), ('b', 2)))
df = DataFrame(od)

od_l = OrderedDict((('df', df),))
df_in_list = ListVector(od_l)
df_in_list_in_list = ListVector(OrderedDict((('df_in_list', df_in_list),))