将numpy数组转换为Matrix rpy2，Kmeans

Question

我有一个 numpy 二维数组 self.sub 我想在 rpy2 kmeans 中使用它。 k = robjects.r.kmeans(self.sub,2,20) 我总是收到以下错误： valueError: 目前该类型无能为力！ 我该怎么办？

Answer 1

从 rpy2 docs 开始，R 矩阵只是带有 dim 属性集的向量。所以对于一个 numpy 二维数组 x

import rpy2.robjects as robj

nr, nc = x.shape
xvec = robj.FloatVector(x.transpose().reshape((x.size))
xr = robj.r.matrix(xvec, nrow=nr, ncol=nc)

您必须转置 numpy 数组，因为 R 按列填充矩阵。

编辑：实际上，您可以在 R 矩阵函数中设置 byrow=True，然后就不需要转置了。