尝试使用 rpy2 将 pandas 数据帧转换为 R 的数据帧时出现无符号整数错误答案

【问题标题】：unsigned integer error while trying to convert pandas dataframe to R's dataframe using rpy2尝试使用 rpy2 将 pandas 数据帧转换为 R 的数据帧时出现无符号整数错误
【发布时间】：2018-09-22 15:45:53
【问题描述】：

我有以下数据：

grp_m1      grp_m2      grp_m3      grp_m4
$50-$75     $50-$75     $50-$75     $50-$75
$50-$75     $50-$75     $50-$75     $50-$75
$150-$175       $150-$175       $150-$175       $150-$175
$100-$125       $100-$125       $100-$125       $100-$125
$150-$175       $125-$150       $125-$150       $125-$150

这些然后被转换为假人。这些假人的 dtype 在 pandas 数据帧中是 unsigned int ，当我尝试使用以下代码将其转换为 R 数据帧时：

from rpy2.robjects import pandas2ri
pandas2ri.activate()
pandas2ri.py2ri(data)

我收到以下错误：

Error while trying to convert the column "grp_m4_$175-$200". Fall back to string conversion. The error is: Cannot convert numpy array of unsigned values -- R does not have unsigned integers.
  (name, str(e)))
C:\Users\hduser\AppData\Local\Continuum\anaconda3.1\lib\site-packages\rpy2-2.9.1-py3.6-win-amd64.egg\rpy2\robjects\pandas2ri.py:61: UserWarning: Error while trying to convert the column "grp_m4_$200-$225". Fall back to string conversion. The error is: Cannot convert numpy array of unsigned values -- R does not have unsigned integers.
  (name, str(e)))

这可以修复还是我需要一起删除这些列，例如如果出现此错误，请跳过该列？

有人可以帮我解决这个问题吗？

【问题讨论】：

我不会说 python，但如果解决方案是将这些值转换为有符号整数，我不会感到惊讶。

标签： python r pandas rpy2

【解决方案1】：

马库斯的回答对我帮助很大。

在我的例子中，我认为这个问题的主要原因是 Pandas.DataFrame 的项目在被转换为虚拟变量后被转换为 numpy.uint8 pd.get_dummies()。

所以，我只是在应用pandas2ri.py2ri(data) 之前将其转换为'int64' by astype()，最后我修复了这个错误。

【讨论】：

【解决方案2】：

您可以使用pandas 中的astype() 将pandas 数据帧中的所有元素转换为所需的dtype。在这种情况下，我们只想将您的虚拟变量转换为 R 可以理解的东西。假设您的数据框仍命名为“数据”，请尝试以下代码：

import pandas as pd

# change unsigned integers to integers
n_data = data.astype('int64') # you could also try float64, if you want

# Check data type
type(n_data.iat[0,0])

# Output
# <class 'numpy.int64'>

from rpy2.robjects import pandas2ri
pandas2ri.activate()

pandas2ri.py2ri(data)

【讨论】：