【发布时间】：2021-02-06 10:06:48
【问题描述】：
我目前正尝试在同一个 Jupyter Notebook 中同时使用 R 和 Python。我成功安装了rpy2；如果我尝试在 R 中写一些东西（将%%R 放在开头）一切正常，但是一旦我尝试使用库，就会出现以下错误：
R[写入控制台]：库中的错误（包名）：没有包 调用 - 包的名称 -
如果我尝试在 R Studio（而不是 Jupyter）中使用相同的库，一切正常。
这是给我带来麻烦的代码：
import os
os.environ['R_HOME'] = r'C:/PROGRA~1/R/R-40~1.0'
os.environ['path'] += r';C:/PROGRA~1/R/R-40~1.0\bin;'
%load_ext rpy2.ipython
%%R
library(readr)
在最后一行之后出现以下错误：
R[写入控制台]：库中的错误（readr）：没有名为“readr”的包
库(readr) 中的错误：没有名为“readr”的包 -------------------------------------------------- ------------------------- RRuntimeError Traceback（最近一次调用 最后的） ~\anaconda3\envs\Cattolica2020\lib\site-packages\rpy2\ipython\rmagic.py 在评估（自我，代码） 267 # 如果代码的最后一行是注释，则需要换行符。 --> 268 值，可见 = ro.r("withVisible({%s\n})" % code) 269 除外 (ri.embedded.RRuntimeError, ValueError) 为异常：
~\anaconda3\envs\Cattolica2020\lib\site-packages\rpy2\robjects_init_.py 在调用（自我，字符串） 415 p = rinterface.parse（字符串） --> 416 res = self.eval(p) 417 返回转换.rpy2py(res)
~\anaconda3\envs\Cattolica2020\lib\site-packages\rpy2\robjects\functions.py 在 调用(self, *args, **kwargs) 第196章 --> 197 返回 (super(SignatureTranslatedFunction, self) 198 .调用（*args，**kwargs））
~\anaconda3\envs\Cattolica2020\lib\site-packages\rpy2\robjects\functions.py 在 调用(self, *args, **kwargs) 124 new_kwargs[k] = 转换.py2rpy(v) --> 125 res = super(Function, self).call(*new_args, **new_kwargs) 126 res = 转换.rpy2py(res)
~\anaconda3\envs\Cattolica2020\lib\site-packages\rpy2\rinterface_lib\conversion.py 在 _(*args, **kwargs) 43 def _(*args, **kwargs): ---> 44 cdata = 函数（*args，**kwargs） 45 # TODO: 测试 cdata 是预期的 CType
~\anaconda3\envs\Cattolica2020\lib\site-packages\rpy2\rinterface.py 在 调用(self, *args, **kwargs) 623 如果错误发生[0]： --> 624 引发嵌入式.RRuntimeError(_rinterface._geterrmessage()) 625返回资源
RRuntimeError: 库中的错误(readr) : 没有调用包 '阅读器'
在处理上述异常的过程中，又发生了一个异常：
RInterpreterError Traceback（最近调用 最后的） ~\anaconda3\envs\Cattolica2020\lib\site-packages\rpy2\ipython\rmagic.py 在 R(self, line, cell, local_ns) 762 其他： --> 763 text_result，结果，可见 = self.eval(code) 第764章
~\anaconda3\envs\Cattolica2020\lib\site-packages\rpy2\ipython\rmagic.py 在评估（自我，代码） 第271章 --> 272 引发 RInterpreterError（代码，str（异常）， 第273章
RInterpreterError：无法解析和评估行 '图书馆（读者）\ n'。 R 错误消息：“库中的错误（阅读器）：那里 没有名为'readr'的包”
在处理上述异常的过程中，又发生了一个异常：
PermissionError Traceback（最近调用 最后）在 ----> 1 get_ipython().run_cell_magic('R', '', 'library(readr)\n')
~\anaconda3\envs\Cattolica2020\lib\site-packages\IPython\core\interactiveshell.py 在 run_cell_magic(self, magic_name, line, cell) 2379
使用 self.builtin_trap: 2380 args = (magic_arg_s, 细胞） -> 2381 结果 = fn(*args, **kwargs) 2382 返回结果 2383在 R(self, line, cell, local_ns)中
~\anaconda3\envs\Cattolica2020\lib\site-packages\IPython\core\magic.py 在 (f, *a, **k) 185 # 但对于那一点状态来说就有点过分了。 第186章 --> 187 调用 = lambda f, *a, **k: f(*a, **k) 188 189 如果可调用（arg）：
~\anaconda3\envs\Cattolica2020\lib\site-packages\rpy2\ipython\rmagic.py 在 R(self, line, cell, local_ns) 782打印（e.err） 783 如果 tmpd: --> 784 rmtree(tmpd) 785返回 786终于：
~\anaconda3\envs\Cattolica2020\lib\shutil.py in rmtree(path, 忽略错误，错误） 735 # 即使 onerror 钩子返回也不能继续 736返回 --> 737 返回_rmtree_unsafe（路径，onerror） 738 739 # 允许自省是否针对符号链接进行加固
~\anaconda3\envs\Cattolica2020\lib\shutil.py in _rmtree_unsafe(path, 错误） 第613章 614 除了 OSError： --> 615 onerror(os.unlink, 全名, sys.exc_info()) 616尝试： 第617章
~\anaconda3\envs\Cattolica2020\lib\shutil.py in _rmtree_unsafe(path, 错误） 611 其他： 612尝试： --> 613 os.unlink(全名) 614 除了 OSError： 615 onerror（os.unlink，全名，sys.exc_info（））
PermissionError：[WinError 32] 不可能的附加文件。 Il 档案è utilizzato da un altro 处理： 'C:\Users\User\AppData\Local\Temp\tmp82eo8sb4\Rplots001.png'
我还尝试验证 Jupyter 和 R 的库目录是否相同，并且我获得了相同的两个目录：
[1] "C:/Users/User/Documents/R/win-library/4.0" [2] "C:/Program Files/R/R-4.0.0/library
我目前正在使用 R 4.0.0 和 Python 3.8.3
【问题讨论】：
标签： python r jupyter-notebook rpy2