用 rpy 发送到 X11 的绘图突然关闭？答案

【问题标题】：Plots made with rpy sent to X11 suddenly close?用 rpy 发送到 X11 的绘图突然关闭？
【发布时间】：2012-09-21 06:27:20
【问题描述】：

我正在使用 RPy2 制作一些情节。绘图显示，但 X11 窗口立即消失。

我输入的内容如下，其中 CCFS 是一个数据矩阵

 import rpy2.robjects as robjects
 r = robjects.r

 pca = r.princomp(CCFS)
 r.plot(pca,main="Eigenvalues")
 r.biplot(pca,main="biplot")
 r['dev.off']() #*EDIT* the problem persists even if I remove this line.

我是否没有包含某些内容？我知道有一些东西要绘制，因为 princomp 返回一个不为空的 ListVector。

【问题讨论】：

您是在交互式提示下执行此操作吗？如果是这样，请尝试不发出最后一个 'dev.off' 操作。
我做了，但没有任何改变。情节确实出现了，但随后就关闭了。我将添加一个 x11 标记。
不，这是在 Python 模块中。
好的，那么它可能会因为程序退出而消失。您需要程序一直运行直到完成，否则您需要使用批处理模式设备，例如 pdf 或 png。
X 服务器继续运行，当然，但是当 Python 脚本 终止时，它打开的所有窗口都会自动关闭。

标签： python x11 graphing rpy2

【解决方案1】：

添加

input()         # for Python3
# raw_input()   # for Python2

到脚本的末尾，以防止程序在用户按下 Enter 之前结束。

【讨论】：

这行得通！但是，它没有解释为什么 X11 窗口不存在。例如，示例 RPy biplot 脚本没有使用它，所以我认为我错过了一个更大的点。
当r 对象被垃圾回收时，它显然会关闭它创建的任何窗口。我不知道您指的是什么 biplot 脚本，但如果它来自文档，它可能只是显示重要的部分，假设您了解 raw_input() 或者您会在更大的脚本中使用代码不会到此为止。
啊，我明白了。在 biplot 行之后，我不会将 RPy 用于脚本中的任何其他内容。因此，当然，智能垃圾收集器会立即关闭所有窗口。好像这还不够，Python 脚本也到此结束。正如@Zack 指出的那样，即使 X11 窗口在垃圾收集器中幸存下来，它也会杀死它。谢谢 - 现在说得通了。
"raw_input" 在 Python 3 中被重命名为 "input"，但是这个技巧仍然有效。

【解决方案2】：

正如 Zack 指出的那样，在交互式图形设备上调用 dev.off() 只会导致设备关闭（并且显示的内容消失）。另一方面，在检查绘图之前，通常需要关闭非交互式设备（参见rpy2's documentation on graphical devices）。

我猜测您的 Python 代码被称为独立程序/脚本，而不是交互式 Python 会话的一部分。换句话说，我怀疑你在 shell 中有类似 python myscript.py 的东西（myscript.py 的内容是你上面的代码）；当脚本结束时，嵌入式 R 显然终止，并带有交互式绘图。这可能也是 Zack 的想法。尝试python -i myscript.py，然后在Python 控制台import sys; sys.exit(0) 中查看退出Python 意味着关闭R 交互设备。

【讨论】：

你是对的。我已经习惯了 Matplotlib 功能，在您关闭绘图之前，脚本会停止，即使您从独立脚本生成绘图也是如此。
未来可能会通过 rpy2 自定义 R 设备以实现这种行为（例如，rpy.sourceforge.net/rpy2/doc-2.3/html/…）。但是，情况还不是这样。