从 R 运行 Python答案

【问题标题】：Running Python from R从 R 运行 Python
【发布时间】：2018-01-17 18:34:45
【问题描述】：

我知道两种语言（R/Python）有多个库可以从另一种语言调用模块。我正在寻找一种方法让我的代码后端在 python 中运行，主要是因为 .pyc 和速度，以及在 R 中运行的前端，所以我可以拥有一个闪亮的应用程序。我找不到为后端制作 python 机器的方法。如果有人知道如何在 R/Rstudio 中做到这一点，请回复。

【问题讨论】：

这个问题似乎相当广泛。 Python到底应该运行什么？如果你想要一个 web 应用程序项目，你可以使用 Django (Python) 之类的东西，并将 R Shiny 应用程序作为 web 应用程序包含在内。但同样，请解释一下你到底想做什么。
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“主要是因为 .pyc 和速度”——这让我觉得这是一个不好的理由：Python 的性能通常很糟糕，而且总体上只比 R 略好一点。此外，.pyc 并没有真正提高性能，而 R 实际上通过编译代码具有更好的等价物，只需将代码放入包中即可。

标签： python r shiny rstudio

【解决方案1】：

我对它的速度没有任何好的基准，但是reticulate 包是我所知道的在不使用网络服务器的情况下将数据传入和传出 python 脚本的最佳方式。它允许您将 python 对象导入到 R 中，它们将像 R 对象一样工作，接受参数并返回值。

当我只想从单个文件运行函数时，我遇到了一些奇怪的问题。它遇到了导入语句和相互调用的多个函数的问题。行之有效的是分别运行import 语句（参见下面的sapply() 语句）并将我的python 脚本中的所有代码合并到一个对象中。这工作得很好，看起来和在 python 中正常运行一样快（尽管我没有做过任何真正的基准测试）

library(reticulate)
use_python(python = '/usr/bin/python') # optionally specify python location

# Import statements are here, not in the file
sapply(c("import mysql.connector", "import re"), py_run_string)

# File contains only the definition of  class MismatchFinder
source_python("python_script.py") 

# Now we can call on that python object from R
result <- MismatchFinder()$find_mismatch(arg1, arg2)

我的印象是，如果您将 python 代码放入一个模块并使用以下代码加载它可能会更简单：py_module <- import_from_path('my_python_module', path = 'PATH')，但我没有尝试过。

希望这会有所帮助！

【讨论】：

【解决方案2】：

我相信您正在寻找的是下面的代码。它将在 R 中运行一个 python 脚本。

system('python3 file_name.py')

【讨论】：

这是否解决了“后端”问题？从 OP 的问题来看，似乎有一些后台活动（例如服务器）需要在 Python 中运行，而只有一个 Web 应用程序需要在 R 中运行。您的解决方案适用于脚本，但如果有更多交互性需要运行，这个解决方案会遇到一些问题。
感谢您的回复。使用 system() 是不够的，因为您实际上无法传递任何参数，您可以简单地运行脚本。如果您知道其他方式，请告诉我。