【发布时间】:2012-09-01 22:58:03
【问题描述】:
我想使用 gnuplot 从数据文件中绘制图形,比如 foo.data。目前,我在命令文件中硬编码数据文件名,比如 foo.plt,然后运行命令gnuplot foo.plg 来绘制数据。但是,我想将数据文件名作为命令参数传递,例如运行命令gnuplot foo.plg foo.data。如何解析 gnuplot 脚本文件中的命令行参数?谢谢。
【问题讨论】:
标签: command-line gnuplot
我想使用 gnuplot 从数据文件中绘制图形,比如 foo.data。目前,我在命令文件中硬编码数据文件名,比如 foo.plt,然后运行命令gnuplot foo.plg 来绘制数据。但是,我想将数据文件名作为命令参数传递,例如运行命令gnuplot foo.plg foo.data。如何解析 gnuplot 脚本文件中的命令行参数?谢谢。
【问题讨论】:
标签: command-line gnuplot
您还可以按照here 的建议通过环境传递信息。 Ismail Amin 的例子在这里重复:
在外壳中:
export name=plot_data_file
在 Gnuplot 脚本中:
#! /usr/bin/gnuplot
name=system("echo $name")
set title name
plot name using ($16 * 8):20 with linespoints notitle
pause -1
【讨论】:
name=plot_data_file ./the_gnuplot_script,而不是导出。
name=value command 告诉 shell 在其环境中使用该特定变量运行命令。我使用的是 bash 4.3.11,但我相信这是一个非常常见的 shell 功能。
您可以通过开关-e输入变量
$ gnuplot -e "filename='foo.data'" foo.plg
然后您可以在 foo.plg 中使用该变量
$ cat foo.plg
plot filename
pause -1
要使“foo.plg”更通用一点,请使用条件:
if (!exists("filename")) filename='default.dat'
plot filename
pause -1
注意-e 必须在文件名之前,否则文件在-e 语句之前运行。特别是,使用 ./foo.plg -e ... CLI 参数运行 shebang gnuplot #!/usr/bin/env gnuplot 将忽略使用提供的参数。
【讨论】:
if 一起使用以提供默认值。 if ! exists("filename") filename='default.data'
if (!exists("filename") 而不是 if ! exists("filename")。
-e 参数中给出每个参数,例如-e "filename='default.data'; foo='bar'" 或 -e "filename='default.data'" -e "foo='bar"'.
-e ... 选项必须位于文件名之前。事实上,从man gnuplot 我们可以读到:-e“command list”在加载下一个输入文件之前执行请求的命令。.
你甚至可以做一些 shell 魔法,例如像这样:
#!/bin/bash
inputfile="${1}" #you could even do some getopt magic here...
################################################################################
## generate a gnuplotscript, strip off bash header
gnuplotscript=$(mktemp /tmp/gnuplot_cmd_$(basename "${0}").XXXXXX.gnuplot)
firstline=$(grep -m 1 -n "^#!/usr/bin/gnuplot" "${0}")
firstline=${firstline%%:*} #remove everything after the colon
sed -e "1,${firstline}d" < "${0}" > "${gnuplotscript}"
################################################################################
## run gnuplot
/usr/bin/gnuplot -e "inputfile=\"${inputfile}\"" "${gnuplotscript}"
status=$?
if [[ ${status} -ne 0 ]] ; then
echo "ERROR: gnuplot returned with exit status $?"
fi
################################################################################
## cleanup and exit
rm -f "${gnuplotscript}"
exit ${status}
#!/usr/bin/gnuplot
plot inputfile using 1:4 with linespoints
#... or whatever you want
我的实现有点复杂(例如,在 sed 调用中替换一些魔法标记,而我已经这样做了......),但为了更好地理解,我简化了这个示例。 你也可以让它更简单.... YMMV。
【讨论】:
你可以在 unix/linux 环境下使用技巧:
在 gnuplot 程序中:绘制“/dev/stdin”...
在命令行中:gnuplot program.plot
【讨论】:
Jari Laamanen 的回答是最好的解决方案。我只想解释如何在 shell 变量中使用超过 1 个输入参数:
output=test1.png
data=foo.data
gnuplot -e "datafile='${data}'; outputname='${output}'" foo.plg
和 foo.plg:
set terminal png
set outputname
f(x) = sin(x)
plot datafile
如您所见,更多参数用分号传递(如在 bash 脚本中),但字符串变量需要用 ' ' 封装(gnuplot 语法,而不是 Bash 语法)
【讨论】:
' 或 " 作为字符串并不重要。 -e 参数周围的外部引号必须是 " 才能替换 bash 变量。以下也可以正常工作:OUTPUT=foobar; gnuplot -e "output=\"$OUTPUT\"; print output"
还有一种方式是这样的:
你有一个名为scriptname.gp的gnuplot脚本:
#!/usr/bin/gnuplot -p
# This code is in the file 'scriptname.gp'
EPATH = $0
FILENAME = $1
plot FILENAME
现在您可以通过这种复杂的语法调用 gnuplot 脚本 scriptname.gp:
echo "call \"scriptname.gp\" \"'.'\" \"'data.dat'\"" | gnuplot
【讨论】:
从 5.0 版开始,您可以将参数传递给带有标志 -c 的 gnuplot 脚本。这些参数通过变量ARG0 到ARG9、ARG0 是脚本以及ARG1 到ARG9 字符串变量来访问。参数的数量由ARGC 给出。
例如下面的脚本(“script.gp”)
#!/usr/local/bin/gnuplot --persist
THIRD=ARG3
print "script name : ", ARG0
print "first argument : ", ARG1
print "third argument : ", THIRD
print "number of arguments: ", ARGC
可以这样称呼:
$ gnuplot -c script.gp one two three four five
script name : script.gp
first argument : one
third argument : three
number of arguments: 5
或在 gnuplot 中作为
gnuplot> call 'script.gp' one two three four five
script name : script.gp
first argument : one
third argument : three
number of arguments: 5
在 gnuplot 4.6.6 和更早版本中,存在一个 call 机制,其语法不同(现已弃用)。通过$#、$0、...、$9 访问参数。例如,上面的相同脚本如下所示:
#!/usr/bin/gnuplot --persist
THIRD="$2"
print "first argument : ", "$0"
print "second argument : ", "$1"
print "third argument : ", THIRD
print "number of arguments: ", "$#"
它在 gnuplot 中被称为(记住,版本
gnuplot> call 'script4.gp' one two three four five
first argument : one
second argument : two
third argument : three
number of arguments: 5
请注意,脚本名称没有变量,因此$0 是第一个参数,变量在引号内调用。没有办法直接从命令行使用它,只能通过@con-fu-se 建议的技巧。
【讨论】:
-c 开关与包含plot 'data' using 0:($1/100) 等行的脚本一起使用。 gnuplot 因错误 invalid expression 而死,因为 $1 消失了。我哪里错了?请注意,没有-c,脚本会成功运行。
gnuplot 5.0 对其进行了测试,在这些示例中添加了plot 'data' using 0:($1/100) 之类的行,但没有得到你所说的。这很少见,因为这个版本定义了变量ARG0--ARG9,而不是$1--$9。我假设您也有 5.0 版(是吗?),因为早期版本不支持 -c 标志。我需要看一个最小的脚本来看看真正的问题在哪里:/
gnuplot 5.0 patchlevel 0。单行脚本print ARG1; plot 'data' using 0:($1/100) 正确打印作为ARG1 传递的值,然后退出,错误invalid expression 指向print ARG1; plot 'data' using 0:(/100) 的斜线。
这个问题得到了很好的回答,但我想我可以在这里找到一个合适的位置来填补,如果只是为了减少像我一样在谷歌上搜索的人的工作量。 vagoberto 的回答给了我解决这个问题的版本所需的东西,所以我将在这里分享我的解决方案。
我在最新的环境中开发了一个情节脚本,它允许我这样做:
#!/usr/bin/gnuplot -c
set terminal png truecolor transparent crop
set output ARG1
set size 1, 0.2
rrLower = ARG2
rrUpper = ARG3
rrSD = ARG4
resultx = ARG5+0 # Type coercion required for data series
resulty = 0.02 # fixed
# etc.
这在最近的 gnuplot(在我的例子中是 5.0.3)的环境中从命令行执行得非常好。
$ ./plotStuff.gp 'output.png' 2.3 6.7 4.3 7
当上传到我的服务器并执行时,它失败了,因为服务器版本是 4.6.4(当前在 Ubuntu 14.04 LTS 上)。 下面的垫片解决了这个问题,无需对原始脚本进行任何更改。
#!/bin/bash
# GPlot v<4.6.6 doesn't support direct command line arguments.
#This script backfills the functionality transparently.
SCRIPT="plotStuff.gp"
ARG1=$1
ARG2=$2
ARG3=$3
ARG4=$4
ARG5=$5
ARG6=$6
gnuplot -e "ARG1='${ARG1}'; ARG2='${ARG2}'; ARG3='${ARG3}'; ARG4='${ARG4}'; ARG5='${ARG5}'; ARG6='${ARG6}'" $SCRIPT
这两个脚本的组合允许将参数从 bash 传递到 gnuplot 脚本,而无需考虑 gnuplot 版本和基本上任何 *nix。
【讨论】:
在shell中写
gnuplot -persist -e "plot filename1.dat,filename2.dat"
并连续获得您想要的文件。 -persist 用于使 gnuplot 屏幕保持不变,只要用户不手动退出它。
【讨论】:
gnuplot -persist -c "myscript.plt" "mydata.csv" "myoutput.png",这个命令可以正常工作,我得到了文件“myoutput.png”,但没有出现gnuplot屏幕(myscript.plt中没有exit命令)。为什么?以及如何在我的示例中显示 gnuplot 屏幕?
@vagoberto 的回答似乎是最好的恕我直言如果您需要位置参数,我还有一点要补充的改进。
vagoberto 的建议:
#!/usr/local/bin/gnuplot --persist
THIRD=ARG3
print "script name : ", ARG0
print "first argument : ", ARG1
print "third argument : ", THIRD
print "number of arguments: ", ARGC
调用者:
$ gnuplot -c script.gp one two three four five
script name : script.gp
first argument : one
third argument : three
number of arguments: 5
对于像我这样的懒惰打字员,可以让脚本可执行 (chmod 755 script.gp)
然后使用以下内容:
#!/usr/bin/env gnuplot -c
THIRD=ARG3
print "script name : ", ARG0
print "first argument : ", ARG1
print "third argument : ", THIRD
print "number of arguments: ", ARGC
执行如下:
$ ./imb.plot a b c d
script name : ./imb.plot
first argument : a
third argument : c
number of arguments: 4
【讨论】: